生物标志
生物标志物是从生物学介质中可以检测到的细胞、生物化学或分子改变。
生物学介质包括各种体液（如血液、尿液）、粪便、组织、细胞、头发、呼气等。
为什么要用生物标志物暴露测量：精确研究对象选择：减少错分机体反应：提前发现个体易感性：健康损害：有助于阐明机理
易感性标志物举例
标志物 暴露 疾病
α1抗胰蛋白酶 吸烟 肺气肿
N-乙酰转移酶 芳香胺 膀胱癌
芳香烃羟化酶 吸烟 肺癌
个体易感性
暴露 内部剂量生物学有 早期反应 机体结构/ 疾病
效剂量 机能改变
B. 古生物标志
一定的植物产生一定类型的孢子或花粉，一般来说，不同的植物便产生不同类型的孢子或花粉。麻黄为旱生裸子植物，它的含量越高，表明气候越干旱，利用麻黄粉属占裸子植物的百分比，可以大体推断出沙四段到沙三段的古气候变化。通过对商51井、盘1井、临18井等20口井的孢粉资料统计，计算出从层序Ⅰ到层序Ⅲ麻黄粉属占裸子植物的百分比分别为16.1%、13.3%、12.9%。这样可以直观地从图中观察到从层序I到层序Ⅲ的古气候变化情况（图7-4）。
图7-4中央隆起带西部层序Ⅰ-层序Ⅲ古植物气候指示直方图
从图中可以发现层序Ⅰ到层序Ⅲ麻黄粉属占裸子植物的百分比逐渐减小，沙四段沉积时期气候干旱，沙三段沉积时期气候逐渐变得湿润。由此看来，沙四段下部的洪水-漫湖沉积正是由于当时气候干旱受洪水作用影响而形成的。
C. 生物标志物的特性
1.具有一定的敏感性，敏感性应高于一般生物检测指标，低剂量下就可测出，可微量操作;
2.具有反应的时间效应。反应要有一定的稳定时间，同时要快速; 3.效应标志物在分子和生化水平上的效应要与高级生物学水平上的效应（如生长、繁殖）紧密相联，各级水平上的效应要有因果关系; 4.具有一定野外应用价值;
5.要求选取对受试生物损害较小的指标，技术易于掌握；
6.具有特异性与预警性（如AchE);
D. 什么是生物标志物检测
1.具有一定的敏感性，敏感性应高于一般生物检测指标，低剂量下就可测出，可微量操作;
2.具有反应的时间效应。反应要有一定的稳定时间，同时要快速; 3.效应标志物在分子和生化水平上的效应要与高级生物学水平上的效应（如生长、繁殖）紧密相联，各级水平上的效应要有因果关系; 4.具有一定野外应用价值;
5.要求选取对受试生物损害较小的指标，技术易于掌握；
6.具有特异性与预警性（如AchE);
E. 问，什么是传统生物标志和omic生物标志
什么是传统生物标志和omic生物标志
现代生物技术是以DNA重组技术的建立为标志。
传统生物技术的技术特征是酿造技术，近代生物技术的技术特征是微生物发酵技术，现代生物技术的技术特征就是以基因工程为首要标志。
重组DNA技术（recombinantDNAtechnique）又称遗传工程，在体外重新组合脱氧核糖核酸（DNA）分子，并使它们在适当的细胞中增殖的遗传操作。这种操作可把特定的基因组合到载体上，并使之在受体细胞中增殖和表达。因此它不受亲缘关系限制，为遗传育种和分子遗传学研究开辟了崭新的途径。
F. 生物标志的种类
1989年美国国家科学院（NAS）将生物标志分为以下三类：
1.暴露生物标志：
⑴内剂量生物标志；
⑵生物有效剂量生物标志。
2.效应生物标志：指机体内可测量的生化、生理或其他方面的改变。
3.易感性生物标志：是指机体接触某种特定环境因子时的反应能力的一类生物标志。
G. 中国专家发现阿尔茨海默病生物标志物，这个标志物是什么
近日，中国专家发现了阿尔兹海默病生物标志物，并发布了“外周血神经源性外体突触素预测无症状阿尔茨海默病”的研究论文在国际医学杂志《阿尔茨海默病和阿尔茨海默病》 ，而贾建平称：“这对阿尔茨海默病早期或无症状期进行有效诊断，可以为其早期干预赢得时间，从而提高治疗效果，降低发病率。” 接下来我们就来了解一下阿尔兹海默病和他的生物标志物：
H. 生物标志化合物
分子有机地球化学是从分子级水平探讨地质体中有机分子化合物演化规律的学科，它是有机地球化学学科的重要分支。目前研究已经证实，地质体中有机质的丰度和组成，特别是分子标志物(或生物标志化合物)组成均与原始生物的种属和地区气候变化密切相关［126，127］。生物体死亡埋藏后有机质的演化又受控于沉积成岩环境，如盐度、氧化还原条件、pH值、粘土矿物的催化作用等。有机生物标志化合物在地质体中发生一系列化学反应，包括氧化、还原、芳构化、异构化、裂解、缩合以及发生于化合物官能团上的许多反应，这些化学反应的速率、反应产物的结构和演化模式取决于上述控制条件。因此，有机地球化学家可以应用生物标志化合物的分布特征、结构演化模式及其参数变化识别地质体中有机质的成熟度、生物输入源、沉积古环境，进行油/油与油/源对比并成功地应用于油气勘探实践中。
长期以来，石油地球化学文献中，生物标志化合物主要用来作为成油母质来源、油源对比、成熟度和生物降解作用等方面的研究标志，而对于生油岩沉积时期，生物标志物的古沉积环境意义，则相对较少论及［128］。运用生物标志化合物判别沉积环境是有机地球化学家和沉积学家长期以来探求的目标。国内外已有不少研究成果［129］。近年来研究表明，沉积环境中氧化还原条件的变化反映在特征生物标志化合物上。例如，缺氧环境可能具有高含量的28，30-二降藿烷［130］，25，28，30-三降藿烷［131］和C35αβ藿烷［132］(Petersetal.，1991)
根据解启来、陈多幅等人［133］对松桃地区冷泉碳酸盐岩———菱锰矿矿石的正构烷烃、类异戊二烯烃、甾和萜类等生物标志化合物特征的较为详细的研究成果，菱锰矿矿石和围岩———碳质页岩具有以下有机地球化学特征:
1.正构烷烃
菱锰矿矿石的正烷烃以中、低碳数为主，呈单峰分布，碳数范围主要介于nC14～nC21，nC21之后的高碳数正烷烃含量甚低，主峰碳为nC16或nC17，无奇偶优势。菱锰矿石和围岩碳质页岩nC20之后的正烷烃丰度很低。
2.类异戊二烯烷烃
菱锰矿石和围岩中均检测到异十六烷(iC16)，降姥鲛烷(iC21)，姥鲛烷(Pr)、植烷(Ph)和异二十一烷(iC21＞)的类异戊二烯烃丰度很低。
3.萜烷和甾烷
菱锰矿矿石和围岩中均检测丰富的三环萜烷和五环萜烷.三环萜烷在地质体中抗生物降解能力强和具较高的热稳定性。碳数介于C19～C29，主峰碳均为C21，从C26开始的三环萜烷具有两个差向异构体，且丰度相当。此外，还检测出C29Ts和C30重排藿烷以及γ－蜡烷，但其丰度均较低。γ－蜡烷的丰度相当于C30升藿烷22R构型的丰度，γ－蜡烷/C30藿烷比值为0.09～0.13。
甾烷在样品中的含量很低，致使m/z217的质量色谱图强度很弱，但仍表现为C27甾烷优势，亦反映出该时期藻类的贡献。
I. 生物标志物的分类
从功能上一般分为:
接触（暴露）生物标志物
（biomarker of exposure）;
效应生物标志物
（biomarker of effect）;
敏感性生物标志物
（biomarker of susceptibility）
J. 生物标志化合物的概念
生物标志化合物又称分子化石、地球化学化石或指纹化石，是指沉积物中的有机质以及原油、油页岩、煤中那些直接或间接来源于活的生物体的有机化合物。这些有机化合物在沉积成岩作用中具有一定稳定性，没有或只有少量的化学变化（图4-4），基本上保持了原始生物的碳骨架，具有明显的原始母质的分子结构特征，分子量较高。简单地讲，生物标志化合物是指直接或通过早期成岩作用从活的生物体中继承下来的一类化学结构比较特殊的有机化合物。
生物标志化合物的组成与原始生物的种属和沉积成岩环境等密切相关。因此，可根据生物标志化合物的分布特点、结构演化模式来确定生油母质的来源、类型，判别其成熟度，进行油源对比；重建沉积环境，恢复古生态特征；研究油气运移规律、煤及煤成气成因；确定生物输入源的类型等。在众多的生物标志化合物中，研究较多的有正构烷烃、类异戊二烯烃、卟啉化合物、萜类化合物、甾类化合物以及芳烃化合物等。