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化學信息學考試

發布時間: 2021-08-07 12:25:24

『壹』 南開大學的化學信息學怎麼樣參考書目都有哪些啊麻煩大家幫幫忙,考研在即,本人目

本人南開化院,南開的化學信息學是化學學院的一門專業選修課,我們上的時候沒有參考書。這門課2個老師,前期教我們如何查找文獻,後期教我們如何用MATLAB,ORIGIN等幾個軟體……挺沒意思的一個課

『貳』 化學信息學都考些什麼內容

http://wenku..com/view/b0cbadaed1f34693daef3e2c.html 這是網路文庫里的 希望對你有幫助

『叄』 我想讀一個化學信息學或者計算機方面的在職博士,誰能推薦一個,要求要好考的。

化學信息學比較好的是吉大,在這塊很強悍,計算機的話,名校就比較多了,清華,國防科大,浙大,交大,華科,東南,哈工,北航這幾所都不錯。你要本科不是計算機的話,不建議報考這幾所,還是報考交叉學科好點,像生物信息學,化學信息學。生物信息學北大,復旦,中山比較厲害。好考的話,報華中農業大學,最近幾年華農的生物信息學引進很多牛人,像張紅雨的團隊,而且組建了生物信息學研究中心,開設了生物信息學的本科班,近幾年會成立信息學院,華農對這塊可謂巨資投入,而且該校生物本來就很厲害,可以考慮。

『肆』 什麼是化學信息學

化學信息學是一門伴隨著計算機等科技發展而形成的一門新的交叉領域的學科,作為化學學科的一個分支學科,它注重的是與計算機以及網路的聯系。從它的名字上可以看出,信息在這這門學科中占據著重要的作用。所以我覺得,文獻在化學信息學中發揮了很關鍵的作用。怎樣查閱文獻怎樣理解文獻,將會是我們初學本門學科的學生要掌握的基礎技能。
化學信息學中中的化學並不是我們廣義上的化學含義,主要是指分子,或者結構信息,化學信息學中"信息"的意思是信息科學和信息理論 。
現如今國外大學學習化學信息的主要內容包括化學分子結構及反應的表徵,數據類型與資料庫,檢索方法,數據分析方法,以及化學信息學在結構解析,反應模擬,合成與葯物設計方面的應用。而我國開課時間晚,學習的內容相對簡單,主要學習化學文獻的查閱等基本內容。
總之,化學信息學"自打於1987年首次被諾貝爾化學獎獲得者J. M. Lehn 教授提出以來,學科就一直處於迅速的發展與改善的狀態中

『伍』 化學信息學的研究內容

1、化合物登記(compound registration)。這包括將每一個化合物的立體化學參數,相關光譜數據(如NMR)、純度數據(如HPLC)、各種生物活性測定數據等各種相關數據動態組合在資料庫中。
2、構效關系的研究工具和技術。這包括應用各種軟體建立各種構效關系模型,其中使用了各種化學計量學方法(如多元統計回歸分析等)。構效關系模型就是關聯用數值表徵的分子結構與其生物活性間的相關性。傳統的QSAR研究是通過自由能將各種獨立變數聯系起來,即相似性是通過簡單的數值來度量的。但是,化學結構之間的相似性度量相對比較復雜,化學結構只有在一定描述的空間中才能被度量和比較。如何描述一個化學分子是相當活躍的研究領域,只有在一個正確有效的描述空間內才有可能客觀度量分子之間的相似性和差異性,從而進行有目的的篩選,並得到一個理想的目標分子庫。現在很多人在研究通過二維、三維甚至更高維的葯效團指紋圖譜來表徵分子,它與傳統的自由能表述完全不同,其效果更為直觀,新的描述方法如特徵樹(feature tree)等也被廣泛應用。
3、虛擬資料庫組裝技術(virtual database assembly)。它通過計算化學方法組合各種基元化學分子結構和片段,虛擬合成大量的候選化合物,然後在這樣一個虛擬化合物庫中篩選目標葯物分子。上述工作包括採用合適的描述因子和相應的演算法進行計算庫設計(computational library design)。值得指出,有效的計算庫在分子設計中往往起關鍵作用。遺傳演算法已成為計算庫設計的重要工具,它能對一個虛擬庫中各個計算化學性質特性值進行優化,從而最優地接近目標。Crame等對庫設計的背景和外延問題作了闡述,Drewry和Young對庫設計的各種方法進行了全面的總結。一種基於已知活性片段(對於目標受體)的方法被應用在單體選擇中。經驗表明,庫的設計應建立在產品空間的計算化學特性值基礎上,而不是在單體空間中。這需要有效的化合物虛擬合成技術,包括:1.片段標記(fragment marking),2.合成反應模擬技術。合成化學家一般偏愛後一種,但在分子的各片段都已定義好的情況下,使用前者更加快速。雜交系統(hybrid system)也被用來進行庫設計。這些方法都需要通過模型計算得到化合物的物理化學性質值。James F Blake[18]對葯物的各種性能值,如吸附性、滲透性、水溶性等預測模型進行了評述。
4.資料庫挖掘技術(database mining)。這主要是從大量的候選類葯分子中尋找出所需要的葯物分子,一般通過亞結構(substructure)、2D或3D相似性度量、分子形狀(shape)、框架(framework)、葯效團等來進行搜索,或者根據受體和配體之間的三維結構進行葯物三維空間篩選。挖掘技術的效果既依賴於對目標分子的認識,如分子三維結構、化學特性等;也依賴於挖掘工具,如計算速度等。從一個多維特徵描述空間中選擇一個子集作為代表集就是所謂分子的虛擬篩選。通過對數據集合的研究,Bayada等得出結論:Ward的二維指紋圖譜對於隨機選擇有最大的改善;但在另一項研究中發現,分割的化學結構(partitioned chemical descriptor)描述空間適用於不同的子集篩選,解決了有關聚類的技術。Deborah K.等使用回歸分類法(recursive partition)進行葯物篩選,並將其運用到14 G-protein 雙受體檢驗中。
5、統計方法和技術。統計方法如主成分分析、因子分析等被廣泛地用來進行分子描述因子(descriptor)的減維,從而可以更加簡單有效地表述分子信息並降低計算的復雜程度。
6.大型數據的可視化表達。在化學信息學的研究中需要對成千上萬個分子的構效關系模型進行表達,若通過圖表的方式用計算機程序自動地進行數據的過濾和表達有利於分析。

『陸』 化學信息學的基本簡介

化學信息學是一門應用信息學方法來解決化學問題的學科。20世紀中後期,伴隨著計算機技術的發展,化學家開始意識到,多年來所積累的大量信息,只有通過計算機技術才能讓科學界容易獲得和處理,換言之,這些信息必須通過資料庫的形式存在,才能為科學界所用。這一新領域出現以後,沒有一個恰當的名稱。活躍在這個領域的化學家總是說他們在「化學信息」領域工作。然而,因為這一名稱難以將處理化學文獻的工作和發展計算機方法來處理化學信息的研究分別開來。所以,一些化學家就稱之為「計算機化學」,以強調採用計算機技術來處理化學信息工作的重要性。但是,這個名稱容易與理論化學計算,即「計算化學」混淆。
1973年,由NATO高級研究所夏季學校在荷蘭Noordwijkerhout舉辦的一次研討班,首次將在在不同化學領域工作,但都是採用計算機方法處理化學信息,或是用計算機技術從化學數據中獲取知識的科學家集中在一起。這次研討班的名稱就定為「化學信息學的計算機表徵與處理」。參加這次會議的科學家主要從事化學結構資料庫,計算機輔助有機合成設計,光譜信息分析和化學計量學等方面的研究,或者開發分子模擬軟體。研討班期間,這些化學家意識到,一個新的研究領域已經形成,而且,它隱含在化學各分支之間。
從那之後,應用於解決化學問題的計算機科學和信息學方法悄然進入了化學的各個領域。
而「化學信息學」這一名詞的出現還是最近的事情。以下是幾個最早的定義:「應用信息技術和信息處理方法已成為葯物發現過程中的一個很重要的部分。化學信息學實際上是一種信息源的混合體。它可將數據轉換為信息,再由信息轉換為知識,從而使我們在葯物先導化合物的識別和組織過程的決策變得更有效。」——Brown Medicinal, Chemistry,1998,33,375-384。「化學信息學——一個老問題的新名詞」——M.Hane,R.Green. Chemical Biology,1999,33,375-384。「化學信息學是一個廣義性的名詞,它將包含化學信息的設計,製造,組織,處理,檢索,分析,傳播,和使用。」——G.Paris (美國化學會 1999年8月會議)。

『柒』 化學信息學課程論文

生物柴油的制備技術及應用現狀
摘 要:生物柴油是一種可再生、更潔凈的新能源內。詳細介紹了酯交容換反應制備生物柴油的化學催
化法、酶催化法和超臨界法,並綜述了生物柴油在國、內外的生產應用現狀。
關鍵詞:生物能;生物柴油;酯交換反應
Abstract:.
reviewed,includingchemicalcatalytic,.Thestatusforpro

『捌』 如何理解化學信息學產生與發展是歷史的必然

化學信息學是近年來發展起來的新學科,
它的產生與發展是基於化學信息量指數般增長

『玖』 化學信息學的學科應用

現代科學的最新發展使得各學科所面對的化學物質體系變得越來越復雜,辨識研究的任務越來越繁重,既有復雜成分定性定量分析問題,又有不確定性的化學模式識別問題;不但有大型資料庫管理問題,還有數據規律的發現問題等等。化學信息學(chmoinformatics) 就是為解決化學領域中大量數據處理和信息提取任務而結合其他相關學科所形成的一門新學科。這門新學科是在化學計量學(chemometrics) 和計算化學(computational chemistry) [3]的基礎上演化和發展起來的,吸收與融合了許多學科的精華。
化學計量學的發展隨著計算機技術的引進,使化學家獲得大量的化學數據成為易事。例如,人們可以在對樣品一無所知的情況下,從分析儀器的計算機數據採集系統獲得諸如峰高、峰位、峰面積等一系列數據。然而,數據並非等同於信息,尤其是有價值的信息。因此,如何利用現代計算工具與信息處理方法快速地處理和解析化學量測數據,成為一個十分迫切的需求。在這種情況下,出現了將數學、統計學與計算機技術應用於化學的化學計量學。作為在80年代蓬勃興起的新技術,它運用數學、統計學、計算機技術等工具設計或選擇化學量測的最優方法,處理與解析化學量測數據,試圖最大限度地提取待測物質體系的化學相關信息。
在分析化學研究方面,高鴻曾預言分析化學與統計學、數學結合的年代將會到來。作為化學量測科學,分析化學從采樣、實驗設計到分析信號的數據處理和解析、化學信息的提取與利用,無一不涉及到化學計量學所研究的統計與數學方法。化學計量學對現代分析化學基礎理論的發展作出了重要貢獻,基本形成了分析信息理論、分析采樣理論、分析實驗設計與優化理論、分析檢測理論、分析校正理論、分析誤差理論、分析儀器信號處理技術、化學資料庫及專家系統技術等,極大地豐富了現代分析化學的理論與技術工具。
此外,化學計量學在工業生產中已得到廣泛應用。例如,多元校正方法已經在啤酒生產和葯物製造中成為常規的監控手段;在造紙、化工、食品、飲料、化妝品等行業中,也被用於過程監測(process monitoring);近來,這些方法還被用於生化發酵、半導體晶片等間歇操作生產過程的監測。到目前為止,化學計量學應用最成功的領域是:多元校正、定量構效關系的建模、化學模式識別、多元過程模擬與監測等。但是,隨著其應用范圍的擴大,研究對象變得越來越復雜,所要處理的數據維數越來越高,數據量也越來越龐大。例如,在葯物設計領域的先導化合物虛擬篩選中,需要處理的化合物達到1040。顯然,傳統的化學計量學已經難以勝任葯物學、生命科學、環境科學、材料科學等領域所提出的化學復雜問題計算和解析,由此迫切需要派生和發展一門包容化學計量學本身的新學科。這就是化學信息學迅速崛起的重要原因。
計算化學的發展計算化學是應化學數據定量分析的需求而產生的,它為化學信息學提供數據計算和信息解析工具。隨著認識層次的深入,化學領域中的各種對象大部分可以用一定的數學模型來抽象和表徵;而模型的求解需要藉助於各種數學的手段來進行。因此,化學學科對科學計算的要求越來越高。例如,各種化學反應可以用一定的微分方程來建模,通過數學模型模擬其反應、傳遞等各種過程。但是,求解微分方程帶來了更高的計算要求。通常,大量的微分方程無法通過理論推導方法求解,這就需要通過數值計算的方法來求近似解。同樣,在微觀世界中,隨著對分子結構的認識不斷深入,我們可以通過各種數學模型來模擬分子的狀態,如通過薛定諤方程可以模擬電子雲的運動狀態;通過量子力學、分子動力學、統計力學等各種方法可以准確地完成分子的模擬;這就意味著現代化學研究中需要建立更多的模型,並需要解決更多的科學計算問題。
隨著科學技術的發展,人們對客觀世界的認識正在逐步加深,各研究領域中的規律性知識不斷地被總結出來,從而使得各種模型的建立成為可能。科學發展到今天,人們已越來越傾向於從數學的角度來看待問題、認識問題和解決問題。因此,計算化學的問世極大地推進了化學及其各相關學科的現代發展,已經成為解決化學領域中復雜問題的技術支撐和有力工具。一般而言,計算化學需要滿足兩個基本要求:1.准確求解問題;2.快速求解問題。因此計算化學一直向著這兩個方向在不斷發展。一方面,它將多元統計分析方法(如PLS、PCA、判別分析、聚類分析、因子分析、回歸分析等)及人工智慧方法(如模式識別、ANN、遺傳演算法、專家系統等)等各類計算手段包容進來,以完成對化學領域對象的准確建模任務;另一方面,它將資料庫技術、快速搜索演算法、並行計算技術等各種提高計算速度的方法包容進來,完成資料庫快速搜索任務,實現葯物虛擬篩選等應用目標。由於在表面科學、葯學和材料科學中需要對延展分子系統(extended molecular system)進行定量描述,而這一類化學體系的實驗信息又很少,這就需要通過計算化學的手段來解決。通常這類科學計算的計算量非常大,以現有計算機的計算能力,按一般的演算法難以快速地給出計算結果,無法實現人機交互。並行計算機及其並行演算法的引入,極大地提高了計算速度,使很多問題的計算求解成為可能。由此可見,計算化學的主要任務就是運用高性能科學計算工具,為化學領域問題求解提供途徑。

『拾』 化學信息學的就業前景怎麼樣

想問一下樓主現在發展如何,化學信息學的就業前景可以嗎?本人也想考這個方向的研究生

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