基康生物
❶ 上海基康生物技术有限公司的赛亚基因科技公司
赛亚基因科技公司创立于2001年3月,资本金为新台币三十五亿元,股东包括和桐集团、华邦电子、国泰人寿、台湾工业银行、富鑫顾问、泰安产物保险、和立联合科技、新光人寿等台湾知名企业。赛亚基因科技公司以亚洲人常见疾病的预防为发展核心,针对亚洲人关系密切的疾病进行诊断及医疗新方法的研发,为亚洲地区少数着眼于人类基因组研发与药物基因组学的生物技术公司。以台湾为基地,赛亚基因将结合两岸三地资源,建立亚洲人常见疾病的基因资料库与技术平台,并与各国研发机构、生技公司、大型药厂合作,开发具有疾病诊断、预防与治疗价值的生技新产品,进军亚洲与世界生技市场。
❷ 基因测定公司
上海基康生物技术有限公司
天斯秀尔生物科技有限公司
北京生物公司
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我们学校是拿到川大测的
❸ agl糖尿病中是什么意思
目的 研究糖原累积病Ⅲ型(glycogen storage diseases type Ⅲ,GSD Ⅲ)患者糖原脱支酶AGL基因突变情况。 方法 采用PCR、DNA直接测序法,对临床表现为肝大、低血糖、生长落后、运动耐力下降的10例GSDⅢ患者的糖原脱支酶基因进行突变检测。检出突变的片段再经DNA双向测序证实。采用限制性内切酶片段长度多态性和荧光PCR结合基因扫描方法证实5个新突变。结果 10例患者中共检出13种突变类型,包括4种剪切突变:IVS6+1G>A、IVS6-1G>A、IVS14+1G>T、IVS26-2A>C;5种无义突变:R469X、R864X、S929X、R977X、Y1428X;3种缺失突变:c.408-411delTTTG、c.2717-2721delAGATC、c.2823delT;1种插入突变:c.4234insT。除IVS14+1G>T、R864X和R977X,其余10种均未见报道过。限制性内切酶片段长度多态性分析证实了3个新剪切突变,荧光PCR结合基因扫描方法证实2个缺失突变的缺失碱基数。2例患者仅检出1个致病突变,其余患者均明确有2个致病突变,突变检出率为90%。IVS14+1G>T突变频率最高,占25%。 结论 10例GSDⅢ型患者的糖原脱支酶基因突变呈高度异质性,发现13种突变,其中10种是新突变,IVS14+1G>T是最常见的突变类型。
【关键词】 糖原贮积病Ⅲ型; 糖原脱支酶系统;突变
糖原累积病Ⅲ型(glycogen storage diseases type Ⅲ,GSDⅢ, MIM # 232 400)是一种常染色体隐性遗传的糖代谢障碍疾病,由于糖原脱支酶(glycogen debranching enzyme,AGL)基因先天性缺陷所致。该酶在糖原分解中发挥α-1,4葡萄糖基转移酶(EC 2.4.1.25)和淀粉1,6-葡萄糖苷酶(EC 3.2.1.33)的作用。患者AGL基因先天性缺陷,糖原支链不能完全被分解,导致带短支链的异常糖原(极限糊精)堆积在肝脏、肌肉和心肌中,临床表现为肝大、空腹低血糖、生长落后、运动耐力下降[1]。AGL基因定位于染色体1p21,长约85 kb,包括35个外显子,其转录起始点为第3外显子的第69个碱基。已报道的AGL基因突变至少达70种,主要来自西方国家,为了解我国患者的基因突变情况,2007年10月-2008年7月,我们对10例GSDⅢ患者进行了基因突变检测。
对象和方法
一、对象
10例患者中9例来自本院,1例来自上海儿童医学中心。9例平均年龄7.2岁(3~14岁),1例是从6岁开始即在我院随诊的患者,现年龄25岁。患者起病年龄为1.5岁(0.5~2岁),主要症状是肝大, 矮小。实验室检查有低血糖,AST和ALT升高,高血脂,肌酸激酶(CK)升高。各项检查结果以中位数(范围)表示,空腹低血糖2.0 mmol/L(0.84~2.99 mmol/L),AST 453 U/L(139~798 U/L),ALT 349 U/L(98~612 U/L),γ-谷胱甘肽转移酶159 U/L (27~327 U/L),血清总胆固醇5.0 mmol/L(3.6~6.02 mmol/L),甘油三酯 2.9 mmol/L(2.05~5.13 mmol/L),CK 1785 U/L(380~4290 U/L),血乳酸1.27 mmol/L(0.7~2.6 mmol/L),血尿酸356.5 mmol/L(231~455 mmol/L)。肝糖原累积病以GSDⅠ型和GSDⅢ型最常见,口服葡萄糖实验可做鉴别诊断[2,3],GSDⅠ型患者常表现为空腹血乳酸增高(>3.0mmol/L)和口服葡萄糖后血乳酸呈明显下降。而本组10例患儿空腹血乳酸水平正常或稍高于正常参考值(<3.0mmol/L),服葡萄糖后血乳酸水平则呈逐渐升高趋势。其次,肝糖原累积病患者中仅GSD Ⅲ型CK可增高[4];GSDⅠ型常见高尿酸血症,而GSDⅢ型血尿酸水平为正常,本组患者CK均异常增高,血尿酸水平多正常(仅1例患儿稍高于正常参考值)。根据上述病史、症状、体征和生化检查临床初诊为GSD Ⅲ型。
患者间无血缘关系,仅1例患儿的父母为近亲婚配。所有检查均获得患者家长的知情同意。对照组为50名健康体检的正常人。
二、实验方法
1.基因组DNA抽取:抽取并分离患者及其父母、对照组外周血白细胞,采用苯酚-氯仿法提取基因组DNA,-20℃保存。
2. AGL基因突变分析:根据AGL基因序列(Genebank Accession No:NM_000642),设计30对引物,扩增包括AGL基因编码区的33个外显子及两端内含子序列。按下列条件进行PCR反应:基因组DNA 200 ng、dNTPs 200 μmol/L、引物0.5 μmo/L 、10×Taq DNA聚合酶缓冲液、Taq DNA聚合酶5 U、加水至终体积50 μl。外显子8、12、16、24、28的PCR扩增程序为:95 ℃预变性5 min,94 ℃变性40 s、44~47 ℃退火35 s、72℃延伸35 s,循环31~35圈,72 ℃再延伸7 min。其余外显子的PCR扩增程序:除退火温度提高到52~58℃范围内外,其余与上述程序相同。PCR产物经纯化后,采用ABI Big Dye Terminator 测序试剂盒在ABI377测序仪上进行测序(上海基康生物技术有限公司)。突变外显子片段均进行DNA双向测序证实,并且对患者父母行相应外显子DNA测序,分析突变来源。
3.限制性内切酶片段长度多态性(RFLP)分析:对测序所发现的3个新剪切突变(IVS6+1G>A、IVS6-1G>A、IVS26-2A>C),在患者家系和对照组中行RFLP分析验证。外显子6野生型504 bp片段可被BsrⅠ酶切成353 bp和151 bp片段,IVS6+1G>A突变使该酶切位点消失,突变片段不可被消化。外显子7野生型551 bp片段可被AluⅠ酶切成363 bp和188 bp片段,IVS6-1G>A突变使该酶切位点消失,突变片段不可被消化。外显子27野生型180 bp片段可被Hpy188 I酶切成97 bp和83 bp片段,IVS26-2A>C突变在108 bp处增加了一酶切位点,97 bp片段又被消化成72 bp和25 bp小片段。酶切产物均经电泳后拍照。
4.荧光PCR结合基因扫描分析:对DNA测序发现的2个缺失突变(c.408-411delTTTG、c.2717-2721delAGATC)采用荧光PCR结合基因扫描技术验证缺失的碱基数。
针对c.408-411delTTTG突变设计引物:
Fam-5F:5\" -CTACCCTTGGACTGTGTTACTCTTCA-3\" ;
5R:5\" -AAAGCAAGCTGACATTACCTGATTC-3\" ;
针对c.2717-2721delAGATC突变设计引物:
Fam-22F :5\" -TCCAATTCTTAGTCTTGCCTCCA-3\" ;
-22R :5\" -CATAGCACCCTCCACCATCTTC-3\" ;
上游引物均用Fam荧光标记。采用多通道PCR仪(PTC-220,美国)扩增后,将PCR产物1μl和甲酰胺3μl、Gene ScanTM500 ROXTM内标1μl混匀变性后,在DNA全自动测序仪(ABI Prism 3100,美国)上进行毛细管电泳,利用Data Colletion 3.0软件收集数据,采用基因扫描软件(GeneScan Analysis3.7)明确扩增各片段长度。
结 果
一、 AGL基因突变情况
10例共检出13种突变类型,包括4种剪切突变:IVS6+1G>A、IVS6-1G>A、IVS14+1G>T、IVS26-2A>C;5种无义突变:R469X、R864X、S929X、R977X、Y1428X;3种缺失突变:c.408-411delTTTG、c.2717-2721delAGATC、c.2823delT;1种插入突变c.4234insT。除IVS14+1G>T、864X、R977X,其余10种均为新突变。2例仅检出1个致病突变,其余患者均明确2个致病突变,总突变检出率为90%。IVS14+1G>T突变率最高,占25%,其次是IVS26-2A>C突变,占10%,其余突变类型各占5%(表1、图1-3)。
二 、 RFLP分析结果
对测序所发现的3个新剪切突变IVS6+1G>A、IVS6-1G>A和IVS26-2A>C分别采用BsrⅠ,AluⅠ和Hpy188 I行RFLP分析如下,50名正常人对照组RFLP分析均未发现携带3个新剪切突变的等位基因(图2):
(1) BsrⅠRFLP分析显示,IVS6+1G>A突变患者携带IVS6+1G>A杂合突变,来源于其父亲,酶切后呈504/353/151 bp带型。
(2) AluⅠRFLP分析显示,IVS6-1G>A突变患者携带IVS6-1G>A杂合突变,来源于其母亲,酶切后呈551/363/188 bp带型。
(3) Hpy188 IRFLP分析显示,IVS26-2A>C突变患者是IVS26-2A>C的纯合突变,酶切后呈83/72/25 bp带型。其父母是该突变的杂合子,酶切后呈97/83/72/25 bp带型。
三、荧光PCR结合基因扫描结果
经测序发现1例患者携带这2个缺失突变:c.408-411delTTTG和c.2717-2721delAGATC,对2个缺失突变行荧光PCR结合基因扫描分析发现, c.408-411delTTTG来源于母亲,
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❺ 上海基康生物技术有限公司的技术服务
个人基因组测序服务:个人基因组测序服务简单来说就是利用“新一代测序技术(next-generation sequencing)”为客户提供其基因组全部DNA序列信息的服务。伴随着人类基因组计划的完成和测序技术的不断发展,普通消费者获得自己的基因组序列信息逐渐成为现实。2007年,新一代测序技术被《Nature Methods》评选为生物领域影响力最大的技术,因为它让绘制人类全基因组图谱由过去的耗费4.37亿美元和13年时间,骤然缩短到如今运行一次即获得50GB的基因组序列数据,并使基因组测序成本由三亿美元骤减至2007年的一百万美元。在新一代测序技术中,片断化的基因组DNA两侧连上接头,随后运用不同的步骤来产生几百万个空间固定的PCR克隆阵列。每个克隆由单个文库片段的多个拷贝组成。之后进行引物杂交和酶延伸反应。由于所有的克隆都是系在同一平面上,这些反应就能够大规模平行进行。同样地,每个延伸所掺入的荧光标记的成像检测也能同时进行,来获取测序数据。酶拷问和成像的持续反复构成了相邻的测序阅读片段。新一代测序技术仍在不断完善中,通量更大,准确率更高,同时测序的成本也更低。2008年个人基因组测序服务已降至十万美元,如今更有报价5万美元甚至更低。随着新一代测序技术的不断发展,该项目的市场也将越来越大。目前全球仅有两家公司提供个人基因组测序服务,基康是拥有国际少数具备个人全基因解码和数据阐释分析能力的的尖端技术公司。
全基因图谱扫描:全基因谱扫描可分析个人独特的基因多型性。所谓全基因谱扫描,就是指将每个人身上的DNA差异关连,数以百万个基因多型性进行一次性扫描,以作为个人基因信息的分析及检视比对,藉此掌握个人生理特质,疾病好发倾向与治疗应用之参考。全基因谱扫描可找出人与人之间0.1%的基因多型性差异,每个人独有的个性、长相、身高体型及生理体制。运用全基因谱扫描及分析,可预知疾病易感性及用药适切性。这份报告参酌了国际最新、最实时的权威科学文献,是累计了无数个数以万计的临床与统计研究导引出的18种以上疾病风险报告,包括一、二型糖尿病、冠状动脉硬化、乳癌、类风湿性关节炎和精神疾病等。它是目前世界最同步,也是最受欧、美医学界认可的个人全基因谱信息分析结果;同时,也是唯一能诠释华人族群体质专属的全基因谱扫描报告。
亲子鉴定:DNA是人体遗传信息的基本载体,人体的染色体是由DNA构成的,每个人体细胞有23对染色体,其分别来自父亲和母亲。父母双方各自提供的23条染色体,在受精后相互配对,构成了23对孩子的染色体,如此循环往复构成生命的延续。由于人体约有30亿个核苷酸构成整个染色体系统,而且在生殖细胞形成前的互换和组合是随机的,所以除同卵双胞胎以外,没有任何两个人具有完全相同的核苷酸序列,这就是人的遗传多态性。尽管遗传多态性的存在,但每个人的染色体必然也只能来自其父母,这就是DNA亲子鉴定的理论基础。亲子鉴定是采用医学、遗传学等学科的理论和现代化DNA检测技术来判断有争议的父母与子女之间是否存在亲生血缘关系。同时可对兄弟姐妹鉴定,表兄弟姐妹鉴定,祖父母、外祖父母与孙子的亲缘关系鉴定,以及家族的近亲和远亲的亲缘鉴定等。 MicroRNA (miRNA) 是人体内最大的一类基因表达的调控因子,在生理和病理过程中发挥十分重要的作用。miRNA在心脏疾病的发生发展过程中起有重要作用,并在心肌肥厚、心律失常、血管新生、血管内膜新生、高血压等疾病发病过程中扮演重要角色,可为先天性和获得性心脏疾病开发新的治疗机会。miRNA作为治疗靶点,不同于经典的治疗方法(一个受体或酶作为高度特异性的靶点)。miRNA通过调节靶基因 mRNA 的稳定性或抑制翻译 而发挥作用。在靶器官中稳定相应 miRNA的表达水平可能成为疾病治疗的一个新靶点。
miRNA具有重要的抑癌基因的功能,可能会对肿瘤的基因治疗产生很大的影响,或可能模拟这一分子进行新药研发。模拟 miRNA的药物免疫原性低,能有效地抑制相应癌基因表达。另一方面,有些 miRNA是癌基因,它们可能成为疾病诊断的生物标志,也可能用来作为癌症基因治疗的药物靶点,利用反义核酸技术破坏其功能。
miR122是肝细胞内表达量最大的miRNA,肩负着维持肝细胞形态、调节胆固醇和脂肪酸的生物合成、影响丙肝病毒(HCV)复制等功能,同时还与肝细胞癌的发生相关。HCV感染以及在细胞内的复制,是病毒与宿主细胞之间相互作用、相互协调的结果,miRNA在其中扮演着非常重要的角色。对 miRNA的深入研究将有助于阐明 HCV的致病机制,同时还可以为抗HCV治疗提供新的分子靶标。
miRNA参与神经系统生长发育和功能调节相关,在神经系统退行性疾病、可塑性障碍性疾病、神经系统肿瘤、脑血管疾病等的发生发展中起有重要作用。miRNA水平检测及其作为治疗靶点将为神经系统疾病的诊断和治疗提供新方法。
❻ 世界上有哪些比较知名的生物技术公司
法国合生元算不算?