真核生物启动子

⑴ 真核生物启动子数据库（Eukaryotic Promoter Database, EPD）

我不太懂，其实可以直接在基因上游1-2kb的范围内设计引物，PCR出来试试就行了。

⑵ 简述真核生物的启动子包括哪两类分别具有何种功能

原核生物启动子：
在基因或操纵子的终末往往具有特殊的终止顺序,它可使转录终止和RNA聚合酶从DNA链上脱落.
例如大肠杆菌色氨酸操纵子后尾含有40bp的GC丰富区,其后紧跟AT丰富区,这就是转录终止子的结构.\x0d终止子有强、弱之分,强终止子含有反向重复顺序,可形成茎环结构,其后面为polyT结构,这样的终止子无需终止蛋白参与即可以使转录终止.
而弱终止子尽管也有反向重复序列,但无polyT结构,需要有终止蛋白参与才能使转录终止.\x0d典型转录终止子的特征：茎环结构,富含GC；含4个以上的U.
原核生物启动子序列包括：
CAP序列,增强聚合酶的结合和转录的起始序列（-70~-40）；
识别区（-35）；
解旋区（-10）；
转录起始位（+1）
真核生物启动子：
启动子（promoter）：
真核基因启动子是在基因转录起始位点（+ 1）及其5’
上游近端大约100~200bp以内（或下游100bp）的一组具有独立功能的DNA序列,每个元件长度约为7~20bp,是决定RNA聚合酶转录起始和转录频率的关键元件.
启动子包括：
A.核心启动子（core promoter）：
是指足以使RNA聚合酶Ⅱ转录正常起始所必需的、最少的DNA序列.其中包括转录起始位点或起始子（initiator）（+1）：
一般是A或G及转录起始位点上游-25/-30bp处富含TA的典型元件TATA框.
.上游启动子元件(upstream promoter element,UPE)：
包括通常-70bp附近的CAAT框：GGCCAATCT和GC框：GGGCGG等,能通过TFⅡ-D复合物调节转录起始的频率,提高转录效率.

⑶ 真核生物的基因表达是什么啊启动子是什么

表达通过蛋白质体现，过程是DNA转录成RNA，RNA上每三个碱基构成一个密码子，于是翻译成蛋白质。启动子是在非编码区上转录开始的标志

⑷ 真核生物上游启动子元件包括哪些

真核生物启动子有三类，分别由RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ进行转录。 类别Ⅰ（class Ⅰ）启动子： 只控制rRNA前体基因的转录，转录产物经切割和加工后生成各种成熟rRNA。 类别Ⅰ启动子由两部分保守序列组成： 核心启动子（core promoter）：位于转录起点附近，从-45至+20； 上游控制元件（upstream control element，UCE）：位于-180至-107； RNA聚合酶Ⅰ对其转录需要2种因子参与： UBF1：一条M为97000的多肽链，结合在上述两部分的富含GC区； 1个TBP，即TATA结合蛋白（TATA-binding protein，TBP）； SL1：一个四聚体蛋白，含有 3个不同的转录辅助因子TAFⅠ； 在SL1因子介导下RNA聚合酶Ⅰ结合在转录起点上并开始转录。

类别Ⅱ（class Ⅱ）启动子： 类别Ⅱ启动子涉及众多编码蛋白质的基因表达的控制。 该类启动子包含4类控制元件：
1基本启动子（basal promoter）：序列为中心在-25至-30左右的7 bp保守区，TATAAAA/T， 称为TATA框或Goldberg-Hogness 框。与RNA聚合酶的定位有关，DNA双链在此解开并决定转录的起点位置。失去TATA框，转录将在许多位点上开始。
2起始子（initiator）：转录起点位置处的一保守序列，共有序列为：PyPyANT(A)PyPy Py为嘧啶碱（C或T），N为任意碱基，A为转录的起点。DNA在此解开并起始转录。
3上游元件（upstream factor）：普遍存在的上游元件有CAAT框、GC框和八聚体（octamer） 框等。CAAT框的共有序列是GCCAATCT，GC框的共有序列为GGGCGG和CCGCCC，八聚体框含有8bp，共有序列为ATGCAAAT；
4应答元件（response element）：诱导调节产生的转录激活因子与靶基因上的应答元件结合。 如热休克效应元件 HSE 的共有序列是 CNNGAANNTCCNNG，可被热休克因子HSF识别和作用；血清效应元件SRE的共有序列CCATATTAGG，可被血清效应因子SRF识别和作用。
参与RNA聚合酶Ⅱ转录起始的各类因子数目很大，可分为3类：
1通用因子（general factor）：作用于基本启动子上的辅助因子称为通用（转录）因子（GTF）， 或基本转录因子（basal transcription），为任何细胞类别Ⅱ启动子起始转录所必需，以TFⅡⅩ来表示，其中Ⅹ按发现先后次序用英文字母定名，如TFⅡA、TFⅡD、TFⅡH。 2上游因子（upstream factor）：或转录辅助因子（transcription ancillary factor），是指识别上 游元件的转录因子。
3可诱导因子（incible factor）：在真核生物中，与细胞类型和发育阶段相关的基因表达， 主要通过转录因子的重新合成来进行调节的，是长期的过程。对外界刺激的快速反应则主要通过转录激活物（transcription activator）的可诱导调节。这些诱导的转录激活因子与靶基因上所谓应答元件相结合。
类别Ⅲ（class Ⅲ）启动子： 类别Ⅲ启动子为RNA聚合酶Ⅲ所识别，他涉及一些小分子RNA的转录。 RNA聚合酶Ⅲ的启动子有3种类型结构：
1类型1基因内启动子：如5S rRNA
基因的启动子，位于转录起点下游，即在基因内部，是 下游启动子，有两个框架序列，被3种辅助因子所识别。5S
rRNA基因的启动子包括框架A（box A）、中间元件（intermediate element
）和框架C（box C）3个元件组成。TFⅢA结合在框架A上，然后促使TFⅢC结合，后者结合导致TFⅢB结合到转录起点附近，并引导RNA聚合酶Ⅲ结合在起点上。TFⅢB使RNA聚合酶Ⅲ正确定位，起“定位因子”（positioning factor）作用。
2类型2基因内启动子：如tRNA基因的启动子，有两个控制元件，分别为框架A和框架B。 TFⅢC结合框架B，其结合区域包括框架A和框架B，然后导致TFⅢB结合到转录起点附近，并引导RNA聚合酶Ⅲ结合在起点上。
3上游启动子：如snRNA基因的启动子，位于转录起点上游。有3个上游元件：OCT（八 聚体基序 octamer motif）、PSE（邻近序列元件 proximal sequence element）、TATA元件。在RNA聚合酶Ⅲ的上游启动子中，只有靠近起点存在TATA元件，就能起始转录。然而PSE和OCT元件的存在将会增加转录效率。

⑸ 原核生物和真核生物的启动子由哪些原件组成

你好！我们知道启动子是一段位于结构基因5'端上游区的DNA序列，能活化RNA聚合酶，调控序列中RNA聚合酶结合模板DNA的部位，具有转录起始的特异性。
原核生物的启动子有-10区Pribnow box(TATAA)和-35区的Sextama box(TTGACA);
真核生物的启动子在-25 ~ -30 区有类似原核生物的Pribnow box的序列，通常称之为TATA box或者Goldberg-Hogness box (TATAAAA)和-75区的CAAT box(GGCCAATC)。
以上是真核和原核生物的启动子比较突出的和比较重要的元件。其他的元件貌似研究的不多，也没有特别提出命名的，所以就不赘述了。
希望能帮到你 ^_^

⑹ 真核生物的启动子和原核生物的启动子的结构有什么区别

原核生物启动子： 在基因或操纵子的终末往往具有特殊的终止顺序,它可使转录终止和RNA聚合酶从DNA链上脱落。 例如大肠杆菌色氨酸操纵子后尾含有40bp的GC丰富区，其后紧跟AT丰富区，这就是转录终止子的结构。 终止子有强、弱之分，强终止子含有反向重复顺序，可形成茎环结构，其后面为polyT结构，这样的终止子无需终止蛋白参与即可以使转录终止。 而弱终止子尽管也有反向重复序列，但无polyT结构，需要有终止蛋白参与才能使转录终止。 典型转录终止子的特征：茎环结构，富含GC；含4个以上的U。 原核生物启动子序列包括：CAP序列，增强聚合酶的结合和转录的起始序列（-70~-40）；识别区（-35）；解旋区（-10）；转录起始位（+1） 真核生物启动子： 启动子（promoter）：真核基因启动子是在基因转录起始位点（+ 1）及其5’上游近端大约100~200bp以内（或下游100bp）的一组具有独立功能的DNA序列，每个元件长度约为7~20bp，是决定RNA聚合酶转录起始和转录频率的关键元件。 启动子包括：A。核心启动子（core promoter）：是指足以使RNA聚合酶Ⅱ转录正常起始所必需的、最少的DNA序列。其中包括转录起始位点或起始子（initiator）（+1）：一般是A或G及转录起始位点上游-25/-30bp处富含TA的典型元件TATA框。 B。

⑺ 比较原核生物和真核生物启动子组成和结构的区别

原核生物启动子的起始子常见结构为CAT，A为起始碱基；真核生物启动子的起始子共有序列为PyPyANT/APyPy。原核生物和真核生物均有富含AT对的区域，原核生物为-10区，共有序列为TATAAT，该段区域是解旋区，使闭合起始复合物转化为开放起始复合物，从而使RNA聚合酶定向转录；真核生物为TATA框，共有序列为TATAAAA，部分真核生物启动子无TATA框，一般是靠GC框来补偿TATA框的作用。原核生物及真核生物启动子的上游及远上游调控元件全然不同，原核生物有-35区，为RNA聚合酶σ亚基识别位点，有些特别强的启动子还含有UP元件，可提高转录效率；真核生物有GC框、CAAT框、远上游元件，GC框有位置依赖性（-90bp），CAAT框处于-80~-75bp处，有提高转录效率的作用，远上游元件由增强子、沉默子、绝缘子、上游激活序列、边际序列等构成。

⑻ 原核生物常见的三种启动子是什么

原核操纵子学说说操纵子上有启动序列,原核生物一般不说启动子
真核生物三种常见启动子：TATA盒,CG盒,CAAT盒

⑼ 真核生物的启动子和原核生物的启动子的结构有什么区别

1、真核生物的启动子和原核生物的启动子的结构序列不同：原核生物启动子序列明显一致；真核不同启动子间不像原核那样有明显共同一致的序列，而且单靠RNA聚合酶难以结合DNA而起动转录，而是需要多种蛋白质因子的相互协调作用。

2、真核生物的启动子和原核生物的启动子的结构长度不同：原核生物的启动子的结构长度较短；真核启动子一般包括转录起始点及其上游约100-200bp序列,包含有若干具有独立功能的DNA序列元件,每个元件约长7-30bp。

3、真核生物的启动子和原核生物的启动子的终止结构不同：原核生物启动子一般在基因或操纵子的终末往往具有特殊的终止顺序,它可使转录终止和RNA聚合酶从DNA链上脱落。

真核基因启动子是在基因转录起始位点（+ 1）及其5’上游近端大约100~200bp以内（或下游100bp）的一组具有独立功能的DNA序列,每个元件长度约为7~20bp,是决定RNA聚合酶转录起始和转录频率的关键元件。

(9)真核生物启动子扩展阅读：

启动子的基本构成有以下几点：

1、转录单元：

转录单元（transcription unit) 是一段从启动子开始至终止子（terminator）结束的DNA序列，RNA聚合酶从转录起点开始沿着模板前进，直到终止子为止，转录出一条RNA链。在细胞中，一个转录单元可以是一个基因，也可以是几个基因。

2、转录起点：

转录起点是指与新生RNA链第一个核苷酸相对应DNA链上的碱基，研究证实通常为一个嘌呤。常把起点前面，即5’末端的序列称为上游（upstream），而把其后而即3’末端的序列称为下游（downstream）。

在描述碱基的位置时，一般用数字表示，起点为+1，下游方向依次为+2、+3……，上游方向依次为-1、-2、-3……。

3、启动子区：

启动子区是RNA聚合酶的结合区，其结构直接关系到转录的效率。在被保护区内有一个由5个核苷酸组成的共同序列，是RNA聚合酶的紧密结合点，称为Pribnow区（Pribnow box），这个区的中央大约位于起点上游10bp处，所以又称为-10区。

许多原核生物都含有这两个重要的启动子区：RNA聚合酶同启动子结合的区域称为启动子区。将各种原核基因同RNA聚合酶全酶结合后，用DNase I水解DNA，最后得到与RNA聚合酶结合而未被水解的DNA片段，这些片段有一个由5个核苷酸（TATAA）组成的共同序列。

4、-10位区和-35位区：

RNA聚合酶并不能重新结合或并不能选择正确的起始点，表明在保护区外可能还存在与RNA聚合酶对启动子的识别有关的序列。果然，科学家不久就从噬菌体的左、右启动子PL及PR和SY40启动子的-35 bp附近找到了另一段共同序列：TTGACA。

原核生物中-10区同-35区之间核苷酸数目的变动会影响基因转录活性的高低，强启动子一般为17±1 bp，当间距小于15 bp或大于20 bp时都会降低启动子的活性。

⑽ 真核生物启动子与原核生物启动子有什么共同点

原核生物启动子：
在基因或操纵子的终末往往具有特殊的终止顺序,它可使转录终止和RNA聚合酶从DNA链上脱落。
例如大肠杆菌色氨酸操纵子后尾含有40bp的GC丰富区，其后紧跟AT丰富区，这就是转录终止子的结构。
终止子有强、弱之分，强终止子含有反向重复顺序，可形成茎环结构，其后面为polyT结构，这样的终止子无需终止蛋白参与即可以使转录终止。
而弱终止子尽管也有反向重复序列，但无polyT结构，需要有终止蛋白参与才能使转录终止。
典型转录终止子的特征：茎环结构，富含GC；含4个以上的U。
原核生物启动子序列包括：CAP序列，增强聚合酶的结合和转录的起始序列（-70~-40）；识别区（-35）；解旋区（-10）；转录起始位（+1）
真核生物启动子：
启动子（promoter）：真核基因启动子是在基因转录起始位点（+ 1）及其5’上游近端大约100~200bp以内（或下游100bp）的一组具有独立功能的DNA序列，每个元件长度约为7~20bp，是决定RNA聚合酶转录起始和转录频率的关键元件。
启动子包括：A。核心启动子（core promoter）：是指足以使RNA聚合酶Ⅱ转录正常起始所必需的、最少的DNA序列。其中包括转录起始位点或起始子（initiator）（+1）：一般是A或G及转录起始位点上游-25/-30bp处富含TA的典型元件TATA框。
B。上游启动子元件(upstream promoter element，UPE)：包括通常-70bp附近的CAAT框：GGCCAATCT和GC框：GGGCGG等，能通过TFⅡ-D复合物调节转录起始的频率，提高转录效率。