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化學結構資料庫

發布時間: 2021-08-03 14:30:11

⑴ 有醫葯中間體的化學結構式的免費資料庫嗎

葯智網資料庫是葯智網旗下全國最大的醫葯資料庫,可在線查詢下載葯品標准,葯品說明書,中國葯典,紅光外譜圖,基本葯物目錄,醫保目錄,葯材標准,葯材辭典,國外葯典,保健品化妝品等一系列標准查詢,具體的查詢葯智網,回答滿意請您採納,謝謝。

生物大分子三級結構資料庫有哪些

生物大分子指的是作為生物體內主要活性成分的各種分子量達到上萬或更多的有機分子。常見的生物大分子包括蛋白質、核酸、脂類、糖類。
這個定義只是概念性的,與生物大分子對立的是小分子物質(二氧化碳、甲烷等)和無機物質,實際上生物大分子的特點在於其表現出的各種生物活性和在生物新陳代謝中的作用。
比如:某些多肽和某些脂類物質的分子量並未達到驚人的地步,但其在生命過程中同樣表現出了重要的生理活性。與一般的生物大分子並無二致。
生物大分子大多數是由簡單的組成結構聚合而成的,蛋白質的組成單位是氨基酸,核酸的組成單位是核苷酸……
生物大分子都可以在生物體內由簡單的結構合成,也都可以在生物體內經過分解作用被分解為簡單結構,一般在合成的過程中消耗能量,分解的過程中釋放能量。
高相對分子量的生物有機化合物(生物大分子)主要是指蛋白質、核酸以及高相對分子量的碳氫化合物。與低相對分子量的生物有機化合物相比,高相對分子量的有機化合物具有更高級的物質群。它們是由低相對分子量的有機化合物經過聚合而成的多分子體系。從化學結構而言,蛋白質是由α-L-氨基酸脫水縮合而成的,核酸是由嘌呤和嘧啶鹼基,與糖D-核糖或2-脫氧-D-核糖)、磷酸脫水縮合而成,多糖是由單糖脫水縮合而成。由此可知,由低相對分子量的生物有機化合物變為高相對分子量的生物有機化合物的化學反應都是脫水縮合反應。
在原始地球條件下,有兩條路徑可以達到脫水縮合以形成高分子:其一是通過加熱,將低相對分子量的構成物質加熱使之脫水而聚合;其二是利用存在於原始地球上的脫水劑來縮合。前者常常是在近於無水的火山環境中進行,後者則可以在水的環境中進行。
生物大分子是生物體的重要組成成份,不但有生物功能,而且分子量較大,其結構也比較復雜。在生物大分子中除主要的蛋白質與核酸外,另外還有糖、脂類和它們相互結合的產物。如糖蛋白、脂蛋白、核蛋白等。它們的分子量往往比一般的無機鹽類大百倍或千倍以上。蛋白質的分子量在一萬至數萬左右,核酸的分子量有的竟達上百萬。這些生物大分子的復雜結構決定了它們的特殊性質,它們在體內的運動和變化體現著重要的生命功能。如進行新陳代謝供給維持生命需要的能量與物質、傳遞遺傳信息、控制胚胎分化、促進生長發育、產生免疫功能等等。

⑶ 分子資料庫的概述

本條目介紹一下全球免費讓公眾使用的化合物及葯物分子資料庫 ,對化學及葯物研究特別有用。
(注意: 以下信息來自於美國MedKoo Biosciences, Inc。)
1.美國國家醫學圖書館化學身份證(CHEMIDPLUS)資料庫
該網頁可檢索葯物化學結構,本網站可以用葯物名稱查找其化學結構. 此外,本資料庫還可以查看毒性, 理化性質, 葯品代碼等。
2. 美國國家醫學圖書館PUBCHEM資料庫可檢索葯物化學結構
本資料庫是美 國國家健康研究所(NIH)和美國國家醫學圖書館(NLM)的大型葯物分子庫。NIH 是美國醫學研究機構,下設27個機構和中心,也是美國健康與人類服務部的一個組成部分。它是一個重要的聯邦機構,執行和支持基礎、臨床及可轉化醫學研究, 調查普通及罕見疾病的原因、治療及治癒情況。PubChem資料庫是美國國家衛生署分子庫路線圖計劃的一個組成部分,是由NIH國家生物技術信心中心開發 的一個化學結構及分子生物活性綜合資料庫.
3。 美國國家癌症研究所(NCI)抗癌葯葯物詞典
該數據收集了4000多條與癌症醫學相關的術語和化合物性質。
4. 葯物合成資料庫(Drug SynthesisDatabase)
該數據是這個葯物在線網推出的數據 庫.本資料庫提供近7000種已上市或在研葯物的葯物合成相關的信息,如葯品名、結構式、化學名、CAS登記號、分子式、分子量、化學活性、開發階段、研 究機構等。最大的優點是快速檢索合成路線,並給出參考文獻來源。
檢索條件支持模糊查詢,各輸入條件間的檢索關系為邏輯與(即AND關系)。檢索條件選擇其一即可查詢。檢索方法包括:
*葯物名稱:(註:包含通用名、商標名、研發代號、異名等)。如Loratadine、Cefpirome.
*化學名稱:(註:包含CA命名、普通命名等)。
*CAS登記號:(註:美國化學文摘登記號)。
5. 有機合成方法資料庫
Since 1921, OrganicSyntheses has provided the chemistry community with annual collections ofdetailed, reliable, and carefully checked proceres for the synthesis oforganic compounds. Some proceres describe practical methods for thepreparation of specific compounds of interest, while other proceresillustrate important synthetic methods with general utility. Each procere iswritten in considerably more detail as compared to typical experimentalproceres in other journals, and each reaction and all characterization datahas been carefully checked for reprocibility in the laboratory ofa member of the Board of Editors.
Organic Synthesesproceres may be accessed either via the tables of contents of indivialvolumes (journal mode) or by concting structure and keywordsearches (database mode). Specific in divial proceres can beaccessed via the table of contents for either the original annual volume orcollective volume in which the procere appeared. Database modeallows users to simultaneously search all volumes of Organic Syntheses bykeywords or by inputting structures and substructures. Structure searchingrequires the ChemDraw plugin which can be downloaded according to theinstructions found in the left margin. Articles from future volumes of OrganicSyntheses that are not yet incorporated in the searchable database can beaccessed on the Org Syn Express page.
6. 有機合成人名反應
該資料庫是葯物在線網推出的數據 庫.TheOrganic Name Reactions (ONR) section is intended to serve the professionalchemist and student by describing organic chemical reactions which have come tobe recognized and referred to by name within the chemistry community. A selectgroup has been chosen for addition to this section. Each reaction descriptionis designed to be informative and representative of the pertinent literature;however, it is not meant to be comprehensive. The descriptions are composed ofthe following: (1) name(s) associated with the reaction, (2) the originaland/or primary contributor(s) connected with the discovery and/or developmentof the reaction, (3) a concise description of the transformation, (4) areaction scheme, (5) key references, and (6) cross references to other ONRbased on commonalities. The index included in this section also listssupplementary terms.
7. 有機合成反應庫
該數據可是這個葯物在線網推出的資料庫.含有400多個有機合成人名反應。
8. 化學物質索引資料庫(Chemical IndexDatabase)
該資料庫是葯物在線網推出的資料庫。 本資料庫為化學物質特性資料庫,包含大量具葯理活性及生物活性的物質性質信息數據。檢索條件支持模糊查詢,各輸入條件間的檢索關系為邏輯與(即AND關 系)。化學結構式為矢量格式圖片,可利用系統自帶圖片預覽工具或支持該格式的工具進行無損縮放查看。檢索結果包括:(a) 索引信息:如物質名稱、化學結構式圖、化學文摘登記號(CAS)、CA名稱、商標名、化學結構式、分子式、分子量、元素組成等。(b) 參考文獻:提供公開物質理化性質、制備方法、分析方法、葯理葯效、臨床研究等的重要期刊、專利、綜述等極具參考價值的文獻。(c) 物質特性:包括理化特性數據,如熔點、沸點、閃點、溶解性、多晶物質狀態、光譜吸收特徵數據、葯物治療分類等.
其檢索的方法有:
*物質名稱(英文名):(包含化學名、通用名、商標名、異名等的全名或部分(大於3個字元),如Ceftriaxone,Adefovir.)
*CA登記號(CAS Registry Number):
*注:美國化學文摘登記號
*參考文獻(Literature References)
*葯理活性(Keywords)
*用途(Usages)
*治療分類(Therapeutic Category)
*分子式(Molecular Formula)
*分子量(Molecular Weight)
*熔點(Melting Point)
*注:熔點值,以攝氏度為單位
*沸點(Boiling Point)
*注:沸點值,以攝氏度為單位
*解離常數(pKa)
*比旋度(Optical Rotation)
*油水分配系數(LogP)
*最大吸收值(Absorption Maximum)
*密度(Density)
*折光率(Index of Refraction)
*毒性數據(Toxicity)

⑷ 有什麼比較全面的化學文獻檢索資料庫

是不是單詞有問題?
先在國內資料庫查「鋁、形態、分析」「鐵、形態、分析」
然後在查到的文獻的參考文獻中找到外文文獻
再看關鍵詞對不對
最後到sciencedirect的資料庫

⑸ 化學資料庫主要有哪些功能

化學資料庫系統是一個將植物資源,植物化學成分及化學結構的多種信息、數據和圖象融為一體的、開和式多功能軟體系統,包括植資源檢索系統、植物化學成分檢索系統及天然產物化學結構檢索系統等三個子系統。

⑹ 怎樣使用ChemFinder進行資料庫檢索

  1. 第1步:本地單擊「開始」菜單,找到ChemOffice文件夾(這里以ChemBioOffice 14為例),打開文件夾並雙擊其中的ChemBioFinder應用程序以打開ChemBioFinder。

  2. 第2步:在ChemBioFinder中單擊「打開」命令並打開資料庫文件(後綴名.cfx),資料庫文件一般位於系統安裝文件目錄中,在目錄中有多個資料庫文件,雙擊打開CS_DEMO.cfx資料庫文件。

  3. 第3步:在CS_DEMO資料庫中,雙擊Structure下面的化學結構可以對化學式進行編輯,繪制者也可以右擊化學結構並選擇Edit in ChemDarw命令在ChemDraw中編輯該化學結構。

  4. 第4步:在ChemBioFinder中單擊Search菜單並選擇Substructure子結構命令。

  5. 第5步:單擊Search菜單的Similarity(類似)命令第6步:最後單擊Search菜單的Find命令開始查找,最後檢索出資料庫中有285條含有苯環子結構記錄以及132條類似物結構記錄。

  6. 當ChemBioFinder檢索結束之後,用戶可以單擊Switch to Table命令將數據轉為列表形式,用戶還可以為列表排序。


⑺ 結構化學在哪個資料庫

ChemBrain XTE V3.5三維分子結構化學資料庫

中國期刊全文資料庫 > 期刊導航 > 核心期刊導航 > 化學類 > 結構化學

NMRShiftDB- 提供有機分子結構及其核磁共振( NMR )的化學位移。nmrshiftdb含有超過22000有機化合物的化學位移數據和19000個譜圖。你可以通過結構、化學位移和核(nucleus?what?)檢索記錄。 NMRShiftDB完全開放,它可以通過編程方式訪問,並且運行在線資料庫的軟體源代碼也可以免費下載。 人用戶可以提交自己的譜圖或者位移數據,以供別人審閱或者列入資料庫中。

Chemical Structure Lookup Service (CSLS)- 一個化學結構目錄。如果你用過Metacrawler, 那麼你應該了解SCLS的原理,即從多個免費化學資料庫種查找數據。你可以通過IUPAC名稱、InChI、結構、SMILES和一系列的分子特徵查找超過兩千七百萬種化合物。你的搜索結構種會包括含有你所要搜索的分子的資料庫的鏈接。用戶界面不止是不好看的問題了,簡直是太爛了。如果你不在意用戶界面的話,CSLS可能是這個列表中最有用的服務之一。

⑻ 我們生物化學講到蛋白質的內容,想問一下一個名詞,什麼叫「蛋白質三級結構的資料庫」

蛋白質結構可以進行預測。通過已知氨基酸序列,利用計算的手段預測蛋白質的二級結構和空間三維結構。
目前蛋白質結構資料庫 PDB中所存儲的蛋白質三維結構主要通過X 射線晶體衍射和核磁共振成像技術,蛋白質的結構檢測比序列檢測要難得多。

⑼ 有機化學哪些資料庫比較好

有機化學類資料庫存儲的是與有機化學領域有關的各類信息。如關於有機化合物結構和各種性質的結構和事實庫I3F I LSTEIN ,關於有機化學反應的資料庫CASREACT, ChemlnformR},R},ACGS和CI I}.h'IREOCT ,關於CRC有機化學數據手冊的資料庫HUL7ClC等Chemical.AI、reaxys和Scifinder是有機合成常用的資料庫。reaxys有遺漏,Scifinder運行成本較高,產品價格不顯示。Chemical.AI是國產的非商業性的免費查合成路線工具。離線資料庫不大好吧,更新速度不能確定,信息接收速度會很慢的。資料庫(Database)是按照數據結構來組織、存儲和管理數據的倉庫,它產生於距今六十多年前,隨著信息技術和市場的發展,特別是二十世紀九十年代以後,數據管理不再僅僅是存儲和管理數據,而轉變成用戶所需要的各種數據管理的方式。資料庫有很多種類型,從最簡單的存儲有各種數據的表格到能夠進行海量數據存儲的大型資料庫系統都在各個方面得到了廣泛的應用。在信息化社會,充分有效地管理和利用各類信息資源,是進行科學研究和決策管理的前提條件。資料庫技術是管理信息系統、辦公自動化系統、決策支持系統等各類信息系統的核心部分,是進行科學研究和決策管理的重要技術手段。資料庫(Database)是按照數據結構來組織、存儲和管理數據的建立在計算機存儲設備上的倉庫。簡單來說是本身可視為電子化的文件櫃——存儲電子文件的處所,用戶可以對文件中的數據進行新增、截取、更新、刪除等操作。在經濟管理的日常工作中,常常需要把某些相關的數據放進這樣的「倉庫」,並根據管理的需要進行相應的處理。例如,企業或事業單位的人事部門常常要把本單位職工的基本情況(職工號、姓名、年齡、性別、籍貫、工資、簡歷等)存放在表中,這張表就可以看成是一個資料庫。有了這個"數據倉庫"我們就可以根據需要隨時查詢某職工的基本情況,也可以查詢工資在某個范圍內的職工人數等等。這些工作如果都能在計算機上自動進行,那我們的人事管理就可以達到極高的水平。此外,在財務管理、倉庫管理、生產管理中也需要建立眾多的這種"資料庫",使其可以利用計算機實現財務、倉庫、生產的自動化管理。

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