原核生物啟動子
原核操縱子學說說操縱子上有啟動序列,原核生物一般不說啟動子
真核生物三種常見啟動子:TATA盒,CG盒,CAAT盒
⑵ 原核生物的啟動子有哪些基本特徵
啟動子:RNA聚合酶識別、結合並開始轉錄所必需的一段DNA序列。
不同的啟動子都存在保守的共同序列,包括RNA聚合酶識別位點和結合位點。
(1)、-10序列在轉錄起點上游大約-10處,有一個6bp的保守序列TATAAT,稱Pribnow框。此段序列出現在-4到-13bp之間,每個位點的保守性在45%-100%。
頻度: T89 A89 T50 A65 A65 T100
據預測,Pribnow框中,一開始的TA和第6位最保守的T在結合RNA聚合酶時起十分重要的作用。
目前認為,Pribnow框決定轉錄方向。酶在此部位與DNA結合形成穩定的復合物,Pribnow框中DNA序列在轉錄方向上解開,形成開放型起始結構,它是RNA聚合酶牢固的結合位點,是啟動子的關鍵部位。
RNA聚合酶的結合,誘導富含AT的Pribnow框的雙鏈解開,然後進一步擴大成17個核苷酸長度的泡狀物,在泡狀物中RNA聚合酶從模板鏈開始轉錄RNA產物。
(2)、-35序列
只含-10序列的DNA不能轉錄,在-10序列上游還有一個保守序列,其中心約在-35位置,稱為-35序列,此序列為RNA酶的識別區域。
各鹼基出現頻率如下:T85 T83 G81 A61 C69 A52 ,其中TTG十分保守。
-35序列的功能:它是原核RNA聚合酶全酶依靠σ因子的初始識別位點。因此,-35序列對RNA聚合酶全酶有很高的親和性。-35序列的核苷酸結構,在很大程度上決定了啟動子的強度,RNA聚合酶易識別強的啟動子。
-35序列提供RNA聚合酶識別信號,
-10序列有助於DNA局部雙鏈解開, 啟動子結構的不對稱性決定了轉錄的方向。
⑶ 原核生物啟動子的類型其保守序列的功能
1.啟動子啟動子是DNA鏈上一段能與RNA聚合酶結合並能起始mRNA合成的序列,它是基因表達不可缺少的重要調控序列.沒有啟動子,基因就不能轉錄.原核生物啟動子是由兩段彼此分開且又高度保守的核苷酸序列組成,對mRNA的合成極為重要.啟動子區域:(1)Pribnow盒,位於轉錄起始位點上游5—10bp,一般由6~8個鹼基組成,富含A和T,故又稱為TATA盒或—10區.啟動子來源不同,Pribnow盒的鹼基順序稍有變化. (2)—35區,位於轉錄起始位點上游35bp處,故稱—35區,一般由10個鹼基組成. 啟動子有強弱之分,雖然原核細胞僅靠一種RNA聚合酶就能負責所有RNA的合成,但它卻不能識別真核基因的啟動子.為了表達真核基因,必須將其克隆在原核啟動子的下游,才在原核表達系統中被轉錄.在原核生物表達系統中,通常使用的可調控的強啟動子有lac (乳糖啟動子)、trp (色氨酸啟動子)、PL和PR(λ噬菌體的左向和右向啟動子)以及tac(乳糖和色氨酸的雜合啟動子)等.
⑷ 真核生物的啟動子和原核生物的啟動子的結構有什麼區別
1、真核生物的啟動子和原核生物的啟動子的結構序列不同:原核生物啟動子序列明顯一致;真核不同啟動子間不像原核那樣有明顯共同一致的序列,而且單靠RNA聚合酶難以結合DNA而起動轉錄,而是需要多種蛋白質因子的相互協調作用。
2、真核生物的啟動子和原核生物的啟動子的結構長度不同:原核生物的啟動子的結構長度較短;真核啟動子一般包括轉錄起始點及其上游約100-200bp序列,包含有若干具有獨立功能的DNA序列元件,每個元件約長7-30bp。
3、真核生物的啟動子和原核生物的啟動子的終止結構不同:原核生物啟動子一般在基因或操縱子的終末往往具有特殊的終止順序,它可使轉錄終止和RNA聚合酶從DNA鏈上脫落。
真核基因啟動子是在基因轉錄起始位點(+ 1)及其5』上游近端大約100~200bp以內(或下游100bp)的一組具有獨立功能的DNA序列,每個元件長度約為7~20bp,是決定RNA聚合酶轉錄起始和轉錄頻率的關鍵元件。
(4)原核生物啟動子擴展閱讀:
啟動子的基本構成有以下幾點:
1、轉錄單元:
轉錄單元(transcription unit) 是一段從啟動子開始至終止子(terminator)結束的DNA序列,RNA聚合酶從轉錄起點開始沿著模板前進,直到終止子為止,轉錄出一條RNA鏈。在細胞中,一個轉錄單元可以是一個基因,也可以是幾個基因。
2、轉錄起點:
轉錄起點是指與新生RNA鏈第一個核苷酸相對應DNA鏈上的鹼基,研究證實通常為一個嘌呤。常把起點前面,即5』末端的序列稱為上游(upstream),而把其後而即3』末端的序列稱為下游(downstream)。
在描述鹼基的位置時,一般用數字表示,起點為+1,下遊方向依次為+2、+3……,上遊方向依次為-1、-2、-3……。
3、啟動子區:
啟動子區是RNA聚合酶的結合區,其結構直接關繫到轉錄的效率。在被保護區內有一個由5個核苷酸組成的共同序列,是RNA聚合酶的緊密結合點,稱為Pribnow區(Pribnow box),這個區的中央大約位於起點上游10bp處,所以又稱為-10區。
許多原核生物都含有這兩個重要的啟動子區:RNA聚合酶同啟動子結合的區域稱為啟動子區。將各種原核基因同RNA聚合酶全酶結合後,用DNase I水解DNA,最後得到與RNA聚合酶結合而未被水解的DNA片段,這些片段有一個由5個核苷酸(TATAA)組成的共同序列。
4、-10位區和-35位區:
RNA聚合酶並不能重新結合或並不能選擇正確的起始點,表明在保護區外可能還存在與RNA聚合酶對啟動子的識別有關的序列。果然,科學家不久就從噬菌體的左、右啟動子PL及PR和SY40啟動子的-35 bp附近找到了另一段共同序列:TTGACA。
原核生物中-10區同-35區之間核苷酸數目的變動會影響基因轉錄活性的高低,強啟動子一般為17±1 bp,當間距小於15 bp或大於20 bp時都會降低啟動子的活性。
⑸ 常用的基因工程原核啟動子有哪些
1、質粒載體 pBR322 2、克隆載體 3、表達質粒載體真核細胞常見表達載體 .pCMVp-NEO-BAN載體 特點:該真核細胞表達載體分子量為6600鹼基對,主要由CMVp啟動子、兔β-球蛋白基因內含子、聚腺嘌呤、氨青黴素抗性基因和抗neo基因以及pBR322骨架構成,在大多數真核細胞內都能高水平穩定地表達外源目的基因. pEGFP,增強型絛色熒光蛋白表達載體(Enhanced Fluorecent Protein Vector) 特點:pEGFP表達載體中含有綠色熒光蛋白,在PCMV啟動子驅動下,在真核細胞中高水平表達.載體骨架中的SV40 origin使該載體在任何錶達SV40 T 抗原的真核細胞內進行復制. pEGFT-Actin,增強型綠色熒光蛋白/人肌動蛋白表達載體 特點:pEGFP-Actin表達載體中含有綠色熒光蛋白和人胞漿β-肌動蛋白基因,在PCMV啟動子驅動下,在真核細胞中高水平表達.載體骨架中的SV40 origin使該載體在任何錶達SV40 T 抗原的真核細胞內進行復制.
⑹ 真核生物的啟動子和原核生物的啟動子的結構有什麼區別
原核生物啟動子: 在基因或操縱子的終末往往具有特殊的終止順序,它可使轉錄終止和RNA聚合酶從DNA鏈上脫落。 例如大腸桿菌色氨酸操縱子後尾含有40bp的GC豐富區,其後緊跟AT豐富區,這就是轉錄終止子的結構。 終止子有強、弱之分,強終止子含有反向重復順序,可形成莖環結構,其後面為polyT結構,這樣的終止子無需終止蛋白參與即可以使轉錄終止。 而弱終止子盡管也有反向重復序列,但無polyT結構,需要有終止蛋白參與才能使轉錄終止。 典型轉錄終止子的特徵:莖環結構,富含GC;含4個以上的U。 原核生物啟動子序列包括:CAP序列,增強聚合酶的結合和轉錄的起始序列(-70~-40);識別區(-35);解旋區(-10);轉錄起始位(+1) 真核生物啟動子: 啟動子(promoter):真核基因啟動子是在基因轉錄起始位點(+ 1)及其5』上游近端大約100~200bp以內(或下游100bp)的一組具有獨立功能的DNA序列,每個元件長度約為7~20bp,是決定RNA聚合酶轉錄起始和轉錄頻率的關鍵元件。 啟動子包括:A。核心啟動子(core promoter):是指足以使RNA聚合酶Ⅱ轉錄正常起始所必需的、最少的DNA序列。其中包括轉錄起始位點或起始子(initiator)(+1):一般是A或G及轉錄起始位點上游-25/-30bp處富含TA的典型元件TATA框。 B。
⑺ 原核啟動子有哪四大要素
典型的原核啟動子有以下四個要素
1.轉錄起始位點
2.-10區
3.-35區
4.-10區域-35區之間的間隔
具體參考網路文庫文獻《真核基因表達調控5》
⑻ 原核生物常見的三種啟動子是什麼多謝了!
原核操縱子學說說操縱子上有啟動序列,原核生物一般不說啟動子
真核生物三種常見啟動子:TATA盒,CG盒,CAAT盒
⑼ 原核生物啟動子的結構特點及功能
1.啟動子
啟動子是DNA鏈上一段能與RNA聚合酶結合並能起始mRNA合成的序列,它是基因表達不可缺少的重要調控序列。沒有啟動子,基因就不能轉錄。原核生物啟動子是由兩段彼此分開且又高度保守的核苷酸序列組成,對mRNA的合成極為重要。啟動子區域:
(1)Pribnow盒,位於轉錄起始位點上游5—10bp,一般由6~8個鹼基組成,富含A和T,故又稱為TATA盒或—10區。啟動子來源不同,Pribnow盒的鹼基順序稍有變化。
(2)—35區,位於轉錄起始位點上游35bp處,故稱—35區,一般由10個鹼基組成。
啟動子有強弱之分,雖然原核細胞僅靠一種RNA聚合酶就能負責所有RNA的合成,但它卻不能識別真核基因的啟動子。為了表達真核基因,必須將其克隆在原核啟動子的下游,才在原核表達系統中被轉錄。在原核生物表達系統中,通常使用的可調控的強啟動子有lac
(乳糖啟動子)、trp
(色氨酸啟動子)、PL和PR(λ噬菌體的左向和右向啟動子)以及tac(乳糖和色氨酸的雜合啟動子)等。