化學合成多肽
① 人工合成多肽可以做co-ip嗎
1。在多肽合成中,所有氨基酸的N端或C端都需要保護其中一個。 2。側鏈有活性基團的都需要保護,如C-OH,C-SH,C-COOH等。
② 多肽的化學合成過程和蛋白質的生物合成過程分別活化的是氨基酸的哪個基團
有氨基酸脫水縮合形成墮胎的過程中,活化的是氨基(-NH2)和羧基(-COOH),至於後面一個問版題,我不知道你問的權是什麼,說具體點好么?你是說整個的蛋白質生物合成過程,還是指從多肽鏈形成蛋白質的過程中啊?
③ 化學多肽合成里去保護是什麼概念
在合成多肽的時候是只需要氨基和羧基發生脫水縮合,所以為了避免副反應的發生,我們用某些化學試劑封鎖了其他不需要反應的活性基團,這稱為基團的保護,合成完畢之後再恢復其原有的形態,故而稱「去保護」。
④ 現有四種人工合成的多肽: (1)多聚甘氨酸; (2)多聚谷氨酸; (3) 多聚亮氨酸;(4)多聚脯氨酸
多聚pro肽鍵沒有醯胺氫。不能成鏈內氫鍵,所以不能形成α螺旋。多聚亮氨酸都可形成。多聚谷氨酸因為在生理狀態帶正電荷,不能形成α螺旋。甘氨酸存在不能形成α螺旋。
⑤ 生物化學中生成含有200個氨基酸殘基的多肽需要消耗多少高能磷酸鍵求解計算公式及原理.謝謝
一共需要801個高能磷酸鍵。合成多肽鏈需要核糖體、tRNA和氨基酸。合成過程中每合成一個肽鍵需要4個高能磷酸鍵:
一、氨基酸和tRNA以酯鍵結合消耗2個高能磷酸鍵。在氨醯tRNA合成酶的作用下分兩步進行
氨基酸+ATP→氨醯-AMP+PPi
氨醯-AMP+tRNA→氨醯-tRNA+AMP
總反應式:氨基酸+ATP+tRNA→氨醯-tRNA+AMP+PPi
二、氨醯-tRNA和核糖體的結合消耗1個高能磷酸鍵。需要氨醯-tRNA結合因子的催化(該因子在細菌中簡寫為EF-Tu,在真核細胞總簡寫為EF-1)。
該因子可以結合有氨醯-tRNA和GTP的核糖體形成四元復合物,同時偶聯上GTP的水解。隨著氨醯-tRNA與核糖體的結合,EF-Tu則與GDP形成復合物核糖體。
三、移位消耗1個高能磷酸鍵。移位的目的是使核糖體沿mRNA移動,使下一個密碼子暴露出來以供繼續翻譯。這一過程由移位因子催化(原核中為EF-G,真核中為EF-2),此過程有GTP的水解。
一共有200個氨基酸,所以需要200X4=800個高能磷酸鍵。
在最開始,核糖體的大小亞基是分離的,再結合的時候也需要消耗一分子的GTP,即再加一個高能磷酸鍵,所以,一共需要801個高能磷酸鍵。
(如果你是分子方面計算的話,有些書上可能會說在多肽形成後從核糖體上水解下來還會需要一個高能磷酸鍵,不過生化的話就沒有。這就需要按情況來了)
⑥ 化學的多肽合成是什麼意思
多肽合成是一個重復添加氨基酸的過程,固相合成順序一般從C端(羧基端)向
N端(氨基端)合成。過去的多肽合成是在溶液中進行的稱為液相合成法。從1963年Merrifield發展成功了固相多肽合成方法以來,經過不斷的改進和完善,到今天固相法已成為多肽和蛋白質合成中的一個常用技術,表現出了經典液相合成法無法比擬的優點,從而大大的減輕了每步產品提純的難度。多肽合成總的來說分成兩種:固相合成和液相多肽合成。
⑦ 多肽化學合成是什麼
現在,人們已經發現和分離出一百多種存在於人體的肽,對於多肽的研究和利用,出現了一個空前的繁榮景象。多肽的全合成不僅具有很重要的理論意義,而且具有重要的應用價值。通過多肽全合成可以驗證一個新的多肽的結構;設計新的多肽,用於研究結構域功能的關系;為多肽生物合成反應機制提供重要的信息;建立模型酶以及合成新的多肽葯物等。二、合成方法多肽的合成主要有兩種途徑:化學合成和生物合成。化學合成主要通過氨基酸縮合反應來實現。為得到具有特定順序的合成多肽,當合成原料中含有官能度大於2的氨基酸單體時,應將不需要反應的基團暫時保護起來,然後再進行連接反應,以保證合成的定向進行。多肽的化學合成有固相合成和液相合成,其主要的區別在於是否使用固相載體。多肽液相合成主要有逐步合成和片段組合兩種策略,
⑧ 如圖是化學合成的兩種mRNA分子.以它們為模板合成的兩種多肽中存在的氨基酸種類最多為() &.
(1)多肽M的模板的鹼基序列為AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG,含有2種密碼子,即AGA、GAG,所以多肽M最多編碼2種氨基酸;
(2)多肽N的模板的鹼基序列為AUCGAUCGAUCGAUCGAUCGAUCG,含有4種密碼子,即AUC、GAU、CGA、UCG,所以多肽N最多編碼4種氨基酸.
故選:C.
⑨ 化學合成的多肽的乙酸鹽和三氟乙酸形式有什麼區別,對活性的影響
tfa鹽的是肯定不能用於人體的
⑩ 多肽合成方法有哪些
多肽合成方法:
醯基疊氮物法
早在1902年,TheodorCurtius就將醯基疊氮物法引入到肽化學中,因此它是最古老的縮合方法之一。在鹼性水溶液中,除了與醯基疊氨縮合的游離氨基酸和肽以外,氨基酸酯可用於有機溶劑中。與其他許多縮合方法不同的是,它不需要增加輔助鹼或另一等當量的氨基組分來捕獲腙酸。
長期以來,一直認為疊氮物法是唯一不發生消旋的縮合方法,隨著可選擇性裂解的氨基酸保護基引入,該方法經歷了一次大規模的復興。該方法的起始原料分別是晶體狀的氨基酸醯肼或肽醯肼64,通過肼解相應的酯很容易得到。在-10℃的鹽酸中,用等當量的亞硝酸鈉使醯肼發生亞硝化而轉化為疊氮化物65,依次洗滌、乾燥,然後與相應的氨基組分反應。有些疊氮化物可用冰水稀釋而沉澱出來。 二苯磷醯基疊氮化物(DPPA)也可以用於醯基疊氮化物的合成。Honzl-Rudinger方法採用亞硝酸叔丁作為亞硝化試劑,並且使疊氮縮合反應可在有機溶劑中進行。因醯基疊氮化物的熱不穩定性,縮合反應需在低溫下進行。當溫度較高時,Curtius重排,即醯基疊氮轉化為異氰酸酯的反應成為一個主要的副反應,最終導致生成副產物脲。由於反應溫度低(如4℃)而導致反應速率相當慢,使得肽縮合反應通常需要幾天才能完全。 對於較長的N端保護的肽鏈,酯基的肼解一般比較困難,因此,使用正交的N保護肼衍生物是一種選擇。在肼基的選擇性脫除後,按倒接(backing-off)策略組合的肽片段可以用於疊氮縮合。
如前所述,雖然疊氮法一直被認為是消旋化傾向最小的縮合方法,但在反應中,過量的鹼會誘發相當大的消旋。因此,在縮合反應期間要避免與鹼接觸,例如,氨基組分的銨鹽應採用N,N-二異丙胺或N-烷基嗎啉代替三乙胺來中和。
雖然有上述局限性,但該方法仍很重要,尤其對於片段縮合而言,因為該方法具有較低的異構化傾向,適用於羥基未保護絲氨酸或蘇氨酸組分時,Nˊ保護的本行醯肼還具有多種用途。
酸酐法
在多肽合成中,最初考慮應用酸酐要追溯到1881年TheodorCurtius對苯甲醯基氨基乙酸合成的早期研究。從氨基乙酸銀與苯甲醯氯的反應中,除獲得苯甲醯氨基乙酸外,還得到了BZ-Glyn-OH(n=2-6)。早期曾認為,當用苯甲醯氯處理時,N-苯甲醯基氨基酸或N-苯甲醯基肽與苯甲酸形成了活性中間體不對稱酸酐。 大約在70年後,TheodorWieland利用這些發現將混合酸酐法用於現代多肽合成。目前,除該方法外,對稱酸酐以及由氨基酸的羧基和氨基甲酸在分子內形成的N-羧基內酸酐(NCA,Leuchsanhydrides)也用肽縮合。最後應該提到,不對稱酸酐常常參與生化反應中的醯化反應。
混合酸酐法
有機羧酸和無機酸皆可用於混合酸酐的形成。然而,僅有幾個得到了廣泛的實際應用,多數情況下,採用氯甲酸烷基酯。過去頻繁使用的氯甲酸乙酯,目前主要被氯甲酸異丁酯所替代。
由羧基組分和氯甲酸酯起始形成的混合酸酐,其氨解反應的區域選擇性依賴依賴於兩個互相競爭的羰基的親電性和(或)空間位阻。在由N保護的氨基酸羧酸鹽(羧基組分)和氯甲酸烷基酯(活化組分,例如源於氯甲酸烷基酯)形成混合酸酐時,親核試劑胺主要進攻氨基酸組分的羧基,形成預期的肽衍生物,並且釋放出遊離酸形式的活性成分。當應用氯甲酸烷基酯(R1=異丁基、乙基等)時,游離的單烷基碳酸不穩定,立即分解為二氧化碳和相應的醇。然而,對於親核進攻的區域選擇性,也有一些相反的報道,產物為氨基甲酸酯和原來的N保護氨基酸組分。 為了形成混合酸酐,將N保護的氨基酸或肽分別溶於二氯甲烷、四氫呋喃、二氧六環、乙腈、乙酸乙酯或DMF中,用等當量的三級鹼(N-甲基哌啶、N-甲基嗎啉、N-乙基嗎啉等)處理。然後,在-15℃--5℃,劇烈攪拌的同時加入氯甲酸烷基酯以形成不對稱酸酐(活化)。經短時間活化後,加入親核性氨基酸組分。如果作為銨鹽使用(需要更多的鹼),必須避免鹼的過量使用。如果嚴格按照以上的反應條件,混合酸酐法很容易進行,是最有效的縮合方法之一。
對稱酸酐法
Nα-醯基氨基酸的對稱酸酐是用於肽鍵形成的高活性中間體。與混合酸酐法相反,它與胺親核試劑的反應沒有模稜兩可的區域選擇性。但肽縮合產率最高,為50%(以羧基組分計)。
雖然由對稱酸酐氨解形成的游離Nα-醯基氨基酸可以和目標肽一起,通過飽和碳酸氫鈉溶液萃取回收,但在最初,這種方法的實用價值極低。對稱酸酐可以用Nα-保護氨基酸與光氣,或方便的碳二亞胺反應製得。兩當量的Nα-保護氨基酸與-當量的碳二亞胺反應有利於對稱酸酐的形成,對稱酸酐可以分離出來,也可不經純化而直接用於後面的縮合反應。基於Nα-烷氧羰基氨基酸的對稱酸酐對水解穩定,可採用類似上述純化混合酸酐的方法進行純化。
由於Boc-保護氨基酸的商品化和合理的價格,在肽鏈的逐步延長中,使用對稱酸酐法日益受到重視。雖然可以買到晶狀的對稱酸酐,但原位制備仍然是一種不錯的選擇。
碳二亞胺法
碳二亞胺類化合物可用於氨基和羧基的縮合。在該類化合物中N,Nˊ-二環己基碳二亞胺(DCC)相對便宜,而且可溶於肽合成常用的溶劑。在肽鍵形成期間,碳二亞胺轉變為相應的脲衍生物,N,Nˊ-二環己基脲可以從反應液中沉澱出來。顯然,碳二亞胺活化後的活性中間體氨解和水解速率不同,使肽合成能在含水介質進行。經幾個課題組的大量研究,確立了以碳二亞胺為縮合劑的肽縮合反應機理,羧酸根離子加成到質子化的碳二亞胺,形成高活性的O-醯基脲;雖然還沒有分離出這個中間體,但通過非常類似的穩定化合物推斷了它的存在。O-醯基脲與氨基組分反應,產生被保護的肽和脲衍生物。或者,與質子化形式處於處於平衡狀態的O-醯基異脲,被第二個羧酸酯親核進攻,產生對稱的氨基酸酐和N,Nˊ-二取代脲。前者與氨基酸反應得到肽衍生物和游離氨基酸。在鹼催化下,使用DCC的副反應使醯基從異脲氧原子向氮原子轉移,產生N-醯基脲71,它不再發生進一步的氨解。不僅過量的鹼可催化O-N的醯基轉移,而且鹼性的氨基組分或碳二亞胺也可催化該副反應。
另外,極性溶劑有利於這一反應途徑。