微生物代謝組

Ⅰ 什麼是代謝流組（fluxomics）...

先來看一下代謝流：
處於一定環境條件下的微生物培養物中,參與代謝的物質在代謝網路的有關代謝途徑中按一定規律流動,形成微生物代謝的物質流.代謝物質的流動過程是一種類似「流體流動」的過程,它具備流動的一切屬性,諸如方向性、連續性、有序性、可調性等等,並且可以接受疏導、阻塞、分流、匯流等「治理」,也可能發生「乾枯」和「 溢出（泛濫）」 等現象.可以採用代謝工程提供的方法來推算代謝網路中代謝流的流量分布.
代謝流組：研究細胞內分子隨時間的動態變化規律.它實際上是更廣泛更系統描述細胞內代謝流通量平衡分析的新詞.

Ⅱ 化能異養型微生物分解代謝和合成代謝的特點分別是什麼

化能異養型微抄生物以有機化合物襲為碳源，以有機物氧化產生的化學能為能源。所以，有機化合物對這些菌來講，既是碳源，又是能源。已知的絕大多數微生物都屬於此類。化能異養型微生物又可分為寄生和腐生兩種類型。寄生是指一種生物寄居於另一種生物體內或體表，從而攝取宿主細胞的營養以維持生命的現象。腐生是指通過分解已死的生物或其他有機物，以維持自身正常生活的生活方式。

異養微生物氧化有機物的方式，根據氧化還原反應中電子受體的不同可分為發酵和呼吸兩種類型，而呼吸又可分為有氧呼吸和無氧呼吸兩種方式。

硝化細菌是化能自養型微生物

Ⅲ 如何利用基因組挖掘微生物次級代謝產物

兩種篩選方法：
建基因組隨機突變文庫 可以用Tn5等轉座子插入 看那個突變體不能產你要的代謝產物了 那它的插入位點肯定是和代謝物合成相關的
或者建質粒文庫 把你的微生物基因組隨機打碎 連接到質粒載體上去 轉入一個不能產這種代謝物的菌株中 看那個克隆可以獲得生產這種代謝物的能力 那轉入的片段肯定是和代謝物合成相關的

Ⅳ 哪些單位能做微生物代謝組學的測定

靶向代謝組學復新技術，區別於傳制統的非定向代謝組學，具有如下優勢： 1.樣品種類多：生物流體（血液、尿、唾液、腸道微生物）、環境樣品、細胞、動植物組織、污水、葯品、食品。 2.化合物涵蓋廣：包括脂類、維生素、核苷酸、神經遞質等700種代謝產物，涵蓋所有主要代謝途徑。 3.分析時間短：我們的方法能在30min同時測定並准確鑒定出700種化合物。 4.復雜的數據處理：專業的數據處理方法和軟體，能對所得數據進行PLS-DA,PCA,ANOVA,VIP,Biomarker等分析。

Ⅳ 微生物次生代謝的特點如何其產物有什麼生理功能

次生代謝是指生物合成生命非必需物質並儲存次生代謝產物的過程。比如喜樹鹼、青蒿素等等大量人類需求的物質都是次生代謝產物。對植物來說：次生代謝是次生物質在植物體內合成和分解的化學過程。
由於次生物質種類繁多,故其代謝反應也千差萬別,且一定的次生代謝反應僅在特定的物種、器官或組織中於一定的環境和時間條件下才進行。對微生物來說：微生物在一定的生長期里合成的一些對微生物本身無明顯作用的物質代謝。

Ⅵ 微生物做代謝組學分析的樣品怎麼處理

微生物代謝組學主要研究細胞生長或生長周期百某一時刻細胞內外所有低分專子量代度屬謝物。分析技術的不斷發展促進了微生物代謝組學研究的進展。本文結合微生物樣品前處理方法,
綜述了目前研究中所採用內的各種分析技術的特點與應用,
並展望微生物代謝組學研究中容分析技術的發展趨勢。

Ⅶ 微生物分為哪三類八群

微生物可以分為原核微生物、真核微生物和非細胞結構微生物三類，也可以分為細菌、病毒、真菌、放線菌、立克次氏體、支原體、衣原體、螺旋體八種。

原核生物是指一類細胞核無核膜包裹，只有稱作核區的裸露DNA的原始單細胞生物。它包括細菌、放線菌、立克次氏體、衣原體、支原體、藍細菌和古細菌等。它們都是單細胞原核生物，結構簡單，沒有細胞器結構，個體微小，一般為1～10 µm，僅為真核細胞的十分之一至萬分之一。

真核生物是一類細胞核具有核膜，能進行有絲分裂，細胞質中存在線粒體或同時存在葉綠體等多種細胞器的生物。菌物界的真菌、黏菌，植物界中的顯微藻類和動物界中的原生、後生動物等都是屬於真核生物類的微生物。

非細胞型微生物是結構最簡單和最小的微生物，它體積微小，能通過除菌濾器，沒有典型的細胞結構，無產生能量的酶系統，只能在宿主活細胞內生長增殖的微生物。

(7)微生物代謝組擴展閱讀：

一、細菌（學名：Bacteria）是生物的主要類群之一，屬於細菌域。也是所有生物中數量最多的一類，據估計，其總數約有5×10^30個。細菌的形狀相當多樣，主要有球狀、桿狀，以及螺旋狀。

二、病毒是一種個體微小，結構簡單，只含一種核酸（DNA或RNA），必須在活細胞內寄生並以復制方式增殖的非細胞型生物。病毒是一種非細胞生命形態，它由一個核酸長鏈和蛋白質外殼構成，病毒沒有自己的代謝機構，沒有酶系統。

三、真菌，是一種真核生物。最常見的真菌是各類蕈類，另外真菌也包括黴菌和酵母。現在已經發現了七萬多種真菌，估計只是所有存在的一小半。大多真菌原先被分入動物或植物，現在成為自己的界，分為四門。

四、放線菌，是一類主要呈菌絲狀生長和以孢子繁殖的陸生性較強大的原核生物。因在固體培養基上呈輻射狀生長而得名。大多數有發達的分枝菌絲。菌絲纖細，寬度近於桿狀細菌，約0.5～1微米。

五、立克次氏體（Rickettsia）為革蘭氏陰性菌，是一類專性寄生於真核細胞內的G-原核生物。是介於細菌與病毒之間，而接近於細菌的一類原核生物。一般呈球狀或桿狀,是專性細胞內寄生物，主要寄生於節肢動物。

六、支原體（mycoplasma）是一類沒有細胞壁、高度多形性、能通過濾菌器、可用人工培養基培養增殖的最小原核細胞型微生物，大小為0.1～0.3微米。由於能形成絲狀與分枝形狀，故稱為支原體。

七、衣原體（chlamydia）是一組極小的，非運動性的，專在細胞內生長的微生物。衣原體可分為4種，即肺炎衣原體、鸚鵡熱衣原體、沙眼衣原體和牛衣原體。衣原體為革蘭陰性病原體，是一類能通過細菌濾器、在細胞內寄生、有獨特發育周期的原核細胞性微生物。

八、螺旋體（spirochete）是一類細長、柔軟、彎曲呈螺旋狀、運動活潑的原核細胞型微生物。在生物學位置上介於細菌與原蟲之間。螺旋體在自然界中分布廣泛，常見於水、土壤及腐敗的有機物上，亦有的存在人體口腔或動物體內。

Ⅷ 微生物代謝工程包括哪幾種主要手段

微生物的基因操作技術有：核酸的凝膠電泳、核酸的分子雜交技術、DNA 序列分析、基 因的定點誘變、細菌的轉化、利用 DNA 與蛋白質的相互作用進行核酸研究、PCR 技術等。
基因定點突變(site-directed mutagenesis)：通過改變基因特定位點核苷酸序列來改變所編 碼的氨基酸序列，用於研究氨基酸殘基對蛋白質的結構、催化活性以及結合配體能力的影響， 也可用於改造 DNA 調控元件特徵序列、修飾表達載體、引入新的酶切位點等。主要採用兩 種 PCR 方法，包括重疊延伸技術和大引物誘變法。在硫化細菌核苷水解酶對底物專一性的研 究中，採用定點突變技術，對編碼 221 位和 228 位氨基酸的 DNA 序列進行突變，改變兩個位點的氨基酸，從而研究氨基酸殘基對底物結合的影響。
基因敲除(gene knock-out)：又稱基因打靶，通過外源 DNA 與染色體 DNA 之間的同源重 組，進行精確的定點修飾和基因改造，具有專一性強、染色體 DNA 可與目的片段共同穩定 遺傳等特點，可分為完全基因敲除和條件型基因敲除。在谷氨酸棒桿菌生產纈氨酸的研究中，採用基因敲除的方法進行高產菌株構建。如 ilvA 基因敲除，使蘇氨酸脫氨酶的合成減少，降低異亮氨酸合成的前體，從而減少異亮氨酸的合成，增加纈氨酸的生成。

Ⅸ 代謝組學可以檢測哪些樣品 a微生物和細胞樣本 b動物體液

代謝組學可以檢測哪些樣品（ABCDE
）：(1分)*
A微生物和細胞樣本
B動物體液（如組織、器官、唾液）
C植物樣本
D血清樣品
E
尿液樣品