真核生物啟動子

⑴ 真核生物啟動子資料庫（Eukaryotic Promoter Database, EPD）

我不太懂，其實可以直接在基因上游1-2kb的范圍內設計引物，PCR出來試試就行了。

⑵ 簡述真核生物的啟動子包括哪兩類分別具有何種功能

原核生物啟動子：
在基因或操縱子的終末往往具有特殊的終止順序,它可使轉錄終止和RNA聚合酶從DNA鏈上脫落.
例如大腸桿菌色氨酸操縱子後尾含有40bp的GC豐富區,其後緊跟AT豐富區,這就是轉錄終止子的結構.\x0d終止子有強、弱之分,強終止子含有反向重復順序,可形成莖環結構,其後面為polyT結構,這樣的終止子無需終止蛋白參與即可以使轉錄終止.
而弱終止子盡管也有反向重復序列,但無polyT結構,需要有終止蛋白參與才能使轉錄終止.\x0d典型轉錄終止子的特徵：莖環結構,富含GC；含4個以上的U.
原核生物啟動子序列包括：
CAP序列,增強聚合酶的結合和轉錄的起始序列（-70~-40）；
識別區（-35）；
解旋區（-10）；
轉錄起始位（+1）
真核生物啟動子：
啟動子（promoter）：
真核基因啟動子是在基因轉錄起始位點（+ 1）及其5』
上游近端大約100~200bp以內（或下游100bp）的一組具有獨立功能的DNA序列,每個元件長度約為7~20bp,是決定RNA聚合酶轉錄起始和轉錄頻率的關鍵元件.
啟動子包括：
A.核心啟動子（core promoter）：
是指足以使RNA聚合酶Ⅱ轉錄正常起始所必需的、最少的DNA序列.其中包括轉錄起始位點或起始子（initiator）（+1）：
一般是A或G及轉錄起始位點上游-25/-30bp處富含TA的典型元件TATA框.
.上游啟動子元件(upstream promoter element,UPE)：
包括通常-70bp附近的CAAT框：GGCCAATCT和GC框：GGGCGG等,能通過TFⅡ-D復合物調節轉錄起始的頻率,提高轉錄效率.

⑶ 真核生物的基因表達是什麼啊啟動子是什麼

表達通過蛋白質體現，過程是DNA轉錄成RNA，RNA上每三個鹼基構成一個密碼子，於是翻譯成蛋白質。啟動子是在非編碼區上轉錄開始的標志

⑷ 真核生物上游啟動子元件包括哪些

真核生物啟動子有三類，分別由RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ進行轉錄。 類別Ⅰ（class Ⅰ）啟動子： 只控制rRNA前體基因的轉錄，轉錄產物經切割和加工後生成各種成熟rRNA。 類別Ⅰ啟動子由兩部分保守序列組成： 核心啟動子（core promoter）：位於轉錄起點附近，從-45至+20； 上游控制元件（upstream control element，UCE）：位於-180至-107； RNA聚合酶Ⅰ對其轉錄需要2種因子參與： UBF1：一條M為97000的多肽鏈，結合在上述兩部分的富含GC區； 1個TBP，即TATA結合蛋白（TATA-binding protein，TBP）； SL1：一個四聚體蛋白，含有 3個不同的轉錄輔助因子TAFⅠ； 在SL1因子介導下RNA聚合酶Ⅰ結合在轉錄起點上並開始轉錄。

類別Ⅱ（class Ⅱ）啟動子： 類別Ⅱ啟動子涉及眾多編碼蛋白質的基因表達的控制。 該類啟動子包含4類控制元件：
1基本啟動子（basal promoter）：序列為中心在-25至-30左右的7 bp保守區，TATAAAA/T， 稱為TATA框或Goldberg-Hogness 框。與RNA聚合酶的定位有關，DNA雙鏈在此解開並決定轉錄的起點位置。失去TATA框，轉錄將在許多位點上開始。
2起始子（initiator）：轉錄起點位置處的一保守序列，共有序列為：PyPyANT(A)PyPy Py為嘧啶鹼（C或T），N為任意鹼基，A為轉錄的起點。DNA在此解開並起始轉錄。
3上游元件（upstream factor）：普遍存在的上游元件有CAAT框、GC框和八聚體（octamer） 框等。CAAT框的共有序列是GCCAATCT，GC框的共有序列為GGGCGG和CCGCCC，八聚體框含有8bp，共有序列為ATGCAAAT；
4應答元件（response element）：誘導調節產生的轉錄激活因子與靶基因上的應答元件結合。 如熱休克效應元件 HSE 的共有序列是 CNNGAANNTCCNNG，可被熱休克因子HSF識別和作用；血清效應元件SRE的共有序列CCATATTAGG，可被血清效應因子SRF識別和作用。
參與RNA聚合酶Ⅱ轉錄起始的各類因子數目很大，可分為3類：
1通用因子（general factor）：作用於基本啟動子上的輔助因子稱為通用（轉錄）因子（GTF）， 或基本轉錄因子（basal transcription），為任何細胞類別Ⅱ啟動子起始轉錄所必需，以TFⅡⅩ來表示，其中Ⅹ按發現先後次序用英文字母定名，如TFⅡA、TFⅡD、TFⅡH。 2上游因子（upstream factor）：或轉錄輔助因子（transcription ancillary factor），是指識別上 游元件的轉錄因子。
3可誘導因子（incible factor）：在真核生物中，與細胞類型和發育階段相關的基因表達， 主要通過轉錄因子的重新合成來進行調節的，是長期的過程。對外界刺激的快速反應則主要通過轉錄激活物（transcription activator）的可誘導調節。這些誘導的轉錄激活因子與靶基因上所謂應答元件相結合。
類別Ⅲ（class Ⅲ）啟動子： 類別Ⅲ啟動子為RNA聚合酶Ⅲ所識別，他涉及一些小分子RNA的轉錄。 RNA聚合酶Ⅲ的啟動子有3種類型結構：
1類型1基因內啟動子：如5S rRNA
基因的啟動子，位於轉錄起點下游，即在基因內部，是 下游啟動子，有兩個框架序列，被3種輔助因子所識別。5S
rRNA基因的啟動子包括框架A（box A）、中間元件（intermediate element
）和框架C（box C）3個元件組成。TFⅢA結合在框架A上，然後促使TFⅢC結合，後者結合導致TFⅢB結合到轉錄起點附近，並引導RNA聚合酶Ⅲ結合在起點上。TFⅢB使RNA聚合酶Ⅲ正確定位，起「定位因子」（positioning factor）作用。
2類型2基因內啟動子：如tRNA基因的啟動子，有兩個控制元件，分別為框架A和框架B。 TFⅢC結合框架B，其結合區域包括框架A和框架B，然後導致TFⅢB結合到轉錄起點附近，並引導RNA聚合酶Ⅲ結合在起點上。
3上游啟動子：如snRNA基因的啟動子，位於轉錄起點上游。有3個上游元件：OCT（八 聚體基序 octamer motif）、PSE（鄰近序列元件 proximal sequence element）、TATA元件。在RNA聚合酶Ⅲ的上游啟動子中，只有靠近起點存在TATA元件，就能起始轉錄。然而PSE和OCT元件的存在將會增加轉錄效率。

⑸ 原核生物和真核生物的啟動子由哪些原件組成

你好！我們知道啟動子是一段位於結構基因5'端上游區的DNA序列，能活化RNA聚合酶，調控序列中RNA聚合酶結合模板DNA的部位，具有轉錄起始的特異性。
原核生物的啟動子有-10區Pribnow box(TATAA)和-35區的Sextama box(TTGACA);
真核生物的啟動子在-25 ~ -30 區有類似原核生物的Pribnow box的序列，通常稱之為TATA box或者Goldberg-Hogness box (TATAAAA)和-75區的CAAT box(GGCCAATC)。
以上是真核和原核生物的啟動子比較突出的和比較重要的元件。其他的元件貌似研究的不多，也沒有特別提出命名的，所以就不贅述了。
希望能幫到你 ^_^

⑹ 真核生物的啟動子和原核生物的啟動子的結構有什麼區別

原核生物啟動子： 在基因或操縱子的終末往往具有特殊的終止順序,它可使轉錄終止和RNA聚合酶從DNA鏈上脫落。 例如大腸桿菌色氨酸操縱子後尾含有40bp的GC豐富區，其後緊跟AT豐富區，這就是轉錄終止子的結構。 終止子有強、弱之分，強終止子含有反向重復順序，可形成莖環結構，其後面為polyT結構，這樣的終止子無需終止蛋白參與即可以使轉錄終止。 而弱終止子盡管也有反向重復序列，但無polyT結構，需要有終止蛋白參與才能使轉錄終止。 典型轉錄終止子的特徵：莖環結構，富含GC；含4個以上的U。 原核生物啟動子序列包括：CAP序列，增強聚合酶的結合和轉錄的起始序列（-70~-40）；識別區（-35）；解旋區（-10）；轉錄起始位（+1） 真核生物啟動子： 啟動子（promoter）：真核基因啟動子是在基因轉錄起始位點（+ 1）及其5』上游近端大約100~200bp以內（或下游100bp）的一組具有獨立功能的DNA序列，每個元件長度約為7~20bp，是決定RNA聚合酶轉錄起始和轉錄頻率的關鍵元件。 啟動子包括：A。核心啟動子（core promoter）：是指足以使RNA聚合酶Ⅱ轉錄正常起始所必需的、最少的DNA序列。其中包括轉錄起始位點或起始子（initiator）（+1）：一般是A或G及轉錄起始位點上游-25/-30bp處富含TA的典型元件TATA框。 B。

⑺ 比較原核生物和真核生物啟動子組成和結構的區別

原核生物啟動子的起始子常見結構為CAT，A為起始鹼基；真核生物啟動子的起始子共有序列為PyPyANT/APyPy。原核生物和真核生物均有富含AT對的區域，原核生物為-10區，共有序列為TATAAT，該段區域是解旋區，使閉合起始復合物轉化為開放起始復合物，從而使RNA聚合酶定向轉錄；真核生物為TATA框，共有序列為TATAAAA，部分真核生物啟動子無TATA框，一般是靠GC框來補償TATA框的作用。原核生物及真核生物啟動子的上游及遠上游調控元件全然不同，原核生物有-35區，為RNA聚合酶σ亞基識別位點，有些特別強的啟動子還含有UP元件，可提高轉錄效率；真核生物有GC框、CAAT框、遠上游元件，GC框有位置依賴性（-90bp），CAAT框處於-80~-75bp處，有提高轉錄效率的作用，遠上游元件由增強子、沉默子、絕緣子、上游激活序列、邊際序列等構成。

⑻ 原核生物常見的三種啟動子是什麼

原核操縱子學說說操縱子上有啟動序列,原核生物一般不說啟動子
真核生物三種常見啟動子：TATA盒,CG盒,CAAT盒

⑼ 真核生物的啟動子和原核生物的啟動子的結構有什麼區別

1、真核生物的啟動子和原核生物的啟動子的結構序列不同：原核生物啟動子序列明顯一致；真核不同啟動子間不像原核那樣有明顯共同一致的序列，而且單靠RNA聚合酶難以結合DNA而起動轉錄，而是需要多種蛋白質因子的相互協調作用。

2、真核生物的啟動子和原核生物的啟動子的結構長度不同：原核生物的啟動子的結構長度較短；真核啟動子一般包括轉錄起始點及其上游約100-200bp序列,包含有若干具有獨立功能的DNA序列元件,每個元件約長7-30bp。

3、真核生物的啟動子和原核生物的啟動子的終止結構不同：原核生物啟動子一般在基因或操縱子的終末往往具有特殊的終止順序,它可使轉錄終止和RNA聚合酶從DNA鏈上脫落。

真核基因啟動子是在基因轉錄起始位點（+ 1）及其5』上游近端大約100~200bp以內（或下游100bp）的一組具有獨立功能的DNA序列,每個元件長度約為7~20bp,是決定RNA聚合酶轉錄起始和轉錄頻率的關鍵元件。

(9)真核生物啟動子擴展閱讀：

啟動子的基本構成有以下幾點：

1、轉錄單元：

轉錄單元（transcription unit) 是一段從啟動子開始至終止子（terminator）結束的DNA序列，RNA聚合酶從轉錄起點開始沿著模板前進，直到終止子為止，轉錄出一條RNA鏈。在細胞中，一個轉錄單元可以是一個基因，也可以是幾個基因。

2、轉錄起點：

轉錄起點是指與新生RNA鏈第一個核苷酸相對應DNA鏈上的鹼基，研究證實通常為一個嘌呤。常把起點前面，即5』末端的序列稱為上游（upstream），而把其後而即3』末端的序列稱為下游（downstream）。

在描述鹼基的位置時，一般用數字表示，起點為+1，下遊方向依次為+2、+3……，上遊方向依次為-1、-2、-3……。

3、啟動子區：

啟動子區是RNA聚合酶的結合區，其結構直接關繫到轉錄的效率。在被保護區內有一個由5個核苷酸組成的共同序列，是RNA聚合酶的緊密結合點，稱為Pribnow區（Pribnow box），這個區的中央大約位於起點上游10bp處，所以又稱為-10區。

許多原核生物都含有這兩個重要的啟動子區：RNA聚合酶同啟動子結合的區域稱為啟動子區。將各種原核基因同RNA聚合酶全酶結合後，用DNase I水解DNA，最後得到與RNA聚合酶結合而未被水解的DNA片段，這些片段有一個由5個核苷酸（TATAA）組成的共同序列。

4、-10位區和-35位區：

RNA聚合酶並不能重新結合或並不能選擇正確的起始點，表明在保護區外可能還存在與RNA聚合酶對啟動子的識別有關的序列。果然，科學家不久就從噬菌體的左、右啟動子PL及PR和SY40啟動子的-35 bp附近找到了另一段共同序列：TTGACA。

原核生物中-10區同-35區之間核苷酸數目的變動會影響基因轉錄活性的高低，強啟動子一般為17±1 bp，當間距小於15 bp或大於20 bp時都會降低啟動子的活性。

⑽ 真核生物啟動子與原核生物啟動子有什麼共同點

原核生物啟動子：
在基因或操縱子的終末往往具有特殊的終止順序,它可使轉錄終止和RNA聚合酶從DNA鏈上脫落。
例如大腸桿菌色氨酸操縱子後尾含有40bp的GC豐富區，其後緊跟AT豐富區，這就是轉錄終止子的結構。
終止子有強、弱之分，強終止子含有反向重復順序，可形成莖環結構，其後面為polyT結構，這樣的終止子無需終止蛋白參與即可以使轉錄終止。
而弱終止子盡管也有反向重復序列，但無polyT結構，需要有終止蛋白參與才能使轉錄終止。
典型轉錄終止子的特徵：莖環結構，富含GC；含4個以上的U。
原核生物啟動子序列包括：CAP序列，增強聚合酶的結合和轉錄的起始序列（-70~-40）；識別區（-35）；解旋區（-10）；轉錄起始位（+1）
真核生物啟動子：
啟動子（promoter）：真核基因啟動子是在基因轉錄起始位點（+ 1）及其5』上游近端大約100~200bp以內（或下游100bp）的一組具有獨立功能的DNA序列，每個元件長度約為7~20bp，是決定RNA聚合酶轉錄起始和轉錄頻率的關鍵元件。
啟動子包括：A。核心啟動子（core promoter）：是指足以使RNA聚合酶Ⅱ轉錄正常起始所必需的、最少的DNA序列。其中包括轉錄起始位點或起始子（initiator）（+1）：一般是A或G及轉錄起始位點上游-25/-30bp處富含TA的典型元件TATA框。
B。上游啟動子元件(upstream promoter element，UPE)：包括通常-70bp附近的CAAT框：GGCCAATCT和GC框：GGGCGG等，能通過TFⅡ-D復合物調節轉錄起始的頻率，提高轉錄效率。